112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3311 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  100 
 
 		 291 aa  579  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  45.88 
 
 		 291 aa  235  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  43.22 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  36.99 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  38.46 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  33.33 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  28.06 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1385  UbiA prenyltransferase  28.38 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0949152  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0306  UbiA prenyltransferase  27.5 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  31.9 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  34.7 
 
 		 282 aa  103  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  32 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  31.17 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  29.27 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  30.99 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  32.84 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  33.95 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  32.76 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  31.65 
 
 		 267 aa  89.7  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.68 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  36.31 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  35.63 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.16 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  35.57 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  35.92 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.72 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  27.17 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  28.51 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  33.56 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  31.38 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  29.56 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  26.84 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  31.13 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  28.95 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  26.53 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0740  UbiA prenyltransferase  28.97 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  31.08 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  24.87 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  30 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  26.85 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.4 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2632  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.25 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  26.16 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.44 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.67 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.78 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  29.76 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  27.37 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.89 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.23 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2123  UbiA prenyltransferase  24.79 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  27.27 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.27 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  27.39 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.25 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  24.84 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  24.2 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  23.76 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3266  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.34 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  29.19 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.89 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.37 
 
 		 334 aa  52.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  25.98 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.31 
 
 		 376 aa  52.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.36 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.18 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.36 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.34 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  25.41 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.16 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  26.9 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0555  UbiA prenyltransferase  25.51 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1866  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.79 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1892  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.58 
 
 		 326 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0278945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.89 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.52 
 
 		 315 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.27 
 
 		 274 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.28 
 
 		 337 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.47 
 
 		 317 aa  48.9  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.59 
 
 		 333 aa  48.9  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.18 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.68 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.1 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.84 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.1 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.69 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  24.35 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.99 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  23.56 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  22.48 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1967  1,4-dihydroxy-2-naphtoate prenyltransferase  26.73 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1981  prenyltransferase  29.27 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.650334  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3844  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.16 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.56 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.9 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1001  hypothetical protein  26.51 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.577031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>