189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0940 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
313 aa  617  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  67 
 
 
313 aa  421  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1145  UbiA prenyltransferase  53.92 
 
 
296 aa  243  3e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  33.33 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.63 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  30.08 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.13 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  24.91 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.38 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  29.66 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3531  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.32 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.18 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  27.32 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  26.91 
 
 
280 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.12 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  32.5 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  30.04 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  26.3 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.5 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  21.7 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  26.73 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0232  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.93 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.408398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  26.73 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  26.73 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.86 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  28.52 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  28.24 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.01 
 
 
376 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  29.89 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.2 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  28.89 
 
 
283 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  27.49 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4142  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  38.02 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1159  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.27 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3733  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.55 
 
 
292 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000311091  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  28.17 
 
 
284 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3679  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.55 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2101  UbiA prenyltransferase  23.53 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0486662  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.78 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.36 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  26.77 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  22.64 
 
 
622 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.69 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  26.7 
 
 
267 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  30.81 
 
 
288 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.35 
 
 
283 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.89 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  24.06 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  24.88 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  28.19 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  23.83 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.77 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  27.59 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.03 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  24.91 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  26.1 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  25.88 
 
 
277 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  27.24 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.81 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  26.1 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.81 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.43 
 
 
333 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  28.51 
 
 
289 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.97 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  26.1 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  25.46 
 
 
285 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  26.7 
 
 
295 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  25.47 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  25.97 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  24.79 
 
 
303 aa  52.8  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.15 
 
 
302 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  25.42 
 
 
293 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  29.86 
 
 
287 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  30.46 
 
 
284 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.28 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  24.6 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.5 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  27.27 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  28.48 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.87 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.84 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  25.41 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  25.11 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  29.56 
 
 
282 aa  50.1  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 
304 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  30.41 
 
 
334 aa  49.3  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.88 
 
 
274 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  25.21 
 
 
289 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2161  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.68 
 
 
285 aa  49.3  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  25.48 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7263  UbiA prenyltransferase  27.89 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000688363  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  32.32 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  26.16 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2658  UbiA prenyltransferase  23.11 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  28.7 
 
 
185 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  24.65 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1692  prenyltransferase  23.87 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.95 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  25.59 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>