118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1449 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
284 aa  531  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  38.41 
 
 
284 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  34.43 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  32.23 
 
 
278 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  31.65 
 
 
281 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.14 
 
 
278 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  34.57 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.65 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  34.91 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  31.14 
 
 
289 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  35.14 
 
 
283 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  32 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.5 
 
 
278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  33.78 
 
 
281 aa  106  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  32.39 
 
 
283 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  32.46 
 
 
259 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  33.21 
 
 
279 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.93 
 
 
278 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  32 
 
 
280 aa  95.9  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  33.33 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  32.61 
 
 
313 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  33.64 
 
 
285 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  32.83 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  33.71 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  34.51 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  27.84 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  29.82 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  24.67 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  26.91 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2123  UbiA prenyltransferase  35.56 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  27.78 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  29.95 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  35.59 
 
 
185 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1385  UbiA prenyltransferase  29.03 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0949152  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  30.67 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.75 
 
 
325 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0740  UbiA prenyltransferase  30.04 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  24.2 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  30.11 
 
 
333 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0555  UbiA prenyltransferase  31.34 
 
 
290 aa  62.4  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.76 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  25 
 
 
333 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.61 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.69 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.39 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.2 
 
 
332 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.42 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  28.9 
 
 
334 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  28.98 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.88 
 
 
330 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.24 
 
 
333 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  29.95 
 
 
324 aa  58.9  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.7 
 
 
315 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  37.06 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  28.37 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.26 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  22.88 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  25.86 
 
 
247 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.91 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.18 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.18 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.05 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.37 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.92 
 
 
330 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.88 
 
 
320 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.04 
 
 
339 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.44 
 
 
333 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  26.19 
 
 
336 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  26.47 
 
 
335 aa  56.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  23.86 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2631  UbiA prenyltransferase  34.21 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.57 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.8 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0749  UbiA prenyltransferase  34.48 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.870578  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.61 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  23.35 
 
 
335 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.38 
 
 
295 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.98 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  27.17 
 
 
423 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.85 
 
 
316 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.67 
 
 
317 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.85 
 
 
316 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.18 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.9 
 
 
376 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2061  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.06 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  40 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.46 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  25.62 
 
 
289 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.51 
 
 
274 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  29.66 
 
 
291 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  28.33 
 
 
482 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.17 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.05 
 
 
305 aa  49.3  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  24.77 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.45 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0306  UbiA prenyltransferase  25.73 
 
 
288 aa  49.3  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  27.01 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.44 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1866  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.7 
 
 
326 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>