225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1089 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
313 aa  619  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  67 
 
 
313 aa  421  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1145  UbiA prenyltransferase  54.92 
 
 
296 aa  256  4e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  27.51 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.09 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  30.51 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  26.61 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  29.61 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  29.21 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.44 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  28.31 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  25.53 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.12 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  27.14 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  28.17 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  29.74 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  27.73 
 
 
298 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  23.21 
 
 
283 aa  63.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  30.04 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  26.47 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  24.3 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  25.25 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  29.96 
 
 
288 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  24.35 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  25.87 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  27.27 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  26.71 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.02 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  28.28 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.69 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  32.2 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  22.95 
 
 
622 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  29.11 
 
 
279 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.59 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  25.74 
 
 
289 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  35.29 
 
 
341 aa  56.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  26.44 
 
 
299 aa  55.8  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  24.12 
 
 
291 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.4 
 
 
301 aa  55.8  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  25.56 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  26.43 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2101  UbiA prenyltransferase  25.15 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0486662  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.41 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  28.95 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  25 
 
 
443 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.27 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  24.41 
 
 
278 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.82 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.74 
 
 
278 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  24.07 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2102  protoheme IX farnesyltransferase  26.53 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0306599  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.09 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  26.04 
 
 
303 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  27.72 
 
 
282 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  28.33 
 
 
283 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  26.21 
 
 
317 aa  52.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1329  protoheme IX farnesyltransferase  28.26 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.99 
 
 
318 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  29.06 
 
 
334 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.37 
 
 
315 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  26.88 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  26.67 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  23.47 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1145  protoheme IX farnesyltransferase  26.96 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  26.79 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.13 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  27.65 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  29.01 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.46 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  24.77 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  26.42 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.43 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  29.34 
 
 
423 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.66 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7263  UbiA prenyltransferase  28.97 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000688363  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3077  protoheme IX farnesyltransferase  26.07 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3266  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.66 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.41 
 
 
315 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  24.73 
 
 
284 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  28.19 
 
 
335 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  28.04 
 
 
283 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  28.5 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.44 
 
 
376 aa  50.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.97 
 
 
278 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  23.45 
 
 
335 aa  49.7  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  23.66 
 
 
285 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.47 
 
 
325 aa  49.3  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2632  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.8 
 
 
310 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.75 
 
 
333 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.94 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.4 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.05 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.41 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  30.21 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.93 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  25.17 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.57 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.57 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  24.74 
 
 
624 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  27.7 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>