44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4538 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2064  UbiA prenyltransferase  64.38 
 
 
295 aa  326  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0738  UbiA prenyltransferase  63.04 
 
 
304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1715  prenyltransferase  28.42 
 
 
303 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0256  prenyltransferase  27.04 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.837385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1926  prenyltransferase  30.47 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.556074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0340  prenyltransferase  25.95 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1981  prenyltransferase  28.34 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.650334  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1225  prenyltransferase  32.28 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  29.17 
 
 
313 aa  57  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1505  UbiA prenyltransferase  24.78 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1440  UbiA prenyltransferase  24.14 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  28.8 
 
 
313 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2435  prenyltransferase  27.87 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0980  UbiA prenyltransferase  26.36 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915074  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.19 
 
 
339 aa  53.1  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1111  UbiA prenyltransferase  22.31 
 
 
289 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0881749  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1569  UbiA prenyltransferase  23.3 
 
 
289 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  33.54 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.37 
 
 
337 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.58 
 
 
316 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.58 
 
 
316 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0383  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  27.33 
 
 
577 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.77 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.16 
 
 
317 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.92 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2849  hypothetical protein  26.48 
 
 
307 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.168855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  31.34 
 
 
281 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  26.58 
 
 
291 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  25.75 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.02 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.53 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  32.76 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  27.84 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.02 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2123  UbiA prenyltransferase  27.56 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.16 
 
 
317 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.02 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1812  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  26.62 
 
 
580 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3266  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.04 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  27.78 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.55 
 
 
302 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.26 
 
 
315 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  29.19 
 
 
305 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>