25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2064 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2064  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
295 aa  581  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  64.38 
 
 
295 aa  338  5.9999999999999996e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0738  UbiA prenyltransferase  67.14 
 
 
304 aa  317  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1715  prenyltransferase  29 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0256  prenyltransferase  28.82 
 
 
298 aa  63.2  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.837385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0340  prenyltransferase  22.44 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1926  prenyltransferase  27.24 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.556074  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0383  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  26.17 
 
 
577 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1225  prenyltransferase  30.06 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1981  prenyltransferase  28.33 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.650334  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1440  UbiA prenyltransferase  22.22 
 
 
340 aa  52.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  27.48 
 
 
313 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2435  prenyltransferase  27.87 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  28.82 
 
 
313 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  27.19 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  30.6 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  27.18 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.22 
 
 
376 aa  45.8  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.74 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  30.81 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1569  UbiA prenyltransferase  21.53 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2738  predicted protein  26.09 
 
 
235 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  25.59 
 
 
318 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  25.59 
 
 
318 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>