17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1926 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1926  prenyltransferase  100 
 
 
307 aa  614  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.556074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1225  prenyltransferase  59.46 
 
 
307 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2435  prenyltransferase  44.16 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1981  prenyltransferase  40.07 
 
 
283 aa  209  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.650334  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0256  prenyltransferase  31.19 
 
 
298 aa  85.9  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.837385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1715  prenyltransferase  28.88 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1001  hypothetical protein  32.41 
 
 
367 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.577031  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2064  UbiA prenyltransferase  27.76 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0738  UbiA prenyltransferase  32.08 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  29.59 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1505  UbiA prenyltransferase  25.86 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0383  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  25.12 
 
 
577 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1440  UbiA prenyltransferase  24.5 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0980  UbiA prenyltransferase  24.12 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915074  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.63 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  33.78 
 
 
283 aa  42.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1111  UbiA prenyltransferase  23.08 
 
 
289 aa  42.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0881749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>