11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1111 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1111  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 289 aa  586  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0881749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1505  UbiA prenyltransferase  83.68 
 
 		 289 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1440  UbiA prenyltransferase  79.51 
 
 		 340 aa  490  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1569  UbiA prenyltransferase  80.21 
 
 		 289 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0980  UbiA prenyltransferase  79.72 
 
 		 295 aa  448  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1715  prenyltransferase  27.32 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0256  prenyltransferase  26.25 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.837385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0340  prenyltransferase  23.21 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0738  UbiA prenyltransferase  24.31 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1001  hypothetical protein  30.43 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.577031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  25 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>