13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1569 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1569  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
289 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1440  UbiA prenyltransferase  82.35 
 
 
340 aa  495  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1111  UbiA prenyltransferase  80.21 
 
 
289 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0881749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1505  UbiA prenyltransferase  81.31 
 
 
289 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0980  UbiA prenyltransferase  79.79 
 
 
295 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915074  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1715  prenyltransferase  27.86 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0256  prenyltransferase  27.22 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.837385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0340  prenyltransferase  23.36 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  25.41 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0738  UbiA prenyltransferase  25.6 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1001  hypothetical protein  29.35 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.577031  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  25.6 
 
 
294 aa  42.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2123  UbiA prenyltransferase  47.22 
 
 
294 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.905572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>