15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1505 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1505  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 289 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1111  UbiA prenyltransferase  83.68 
 
 		 289 aa  498  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0881749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0980  UbiA prenyltransferase  88.15 
 
 		 295 aa  494  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1440  UbiA prenyltransferase  78.2 
 
 		 340 aa  475  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1569  UbiA prenyltransferase  81.31 
 
 		 289 aa  464  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1715  prenyltransferase  29.72 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0340  prenyltransferase  26.72 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0256  prenyltransferase  25.74 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.837385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1926  prenyltransferase  25.86 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.556074  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  24.73 
 
 		 295 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0738  UbiA prenyltransferase  23.2 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1981  prenyltransferase  23 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.650334  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2435  prenyltransferase  22.64 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0383  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  27.17 
 
 		 577 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1001  hypothetical protein  20.91 
 
 		 367 aa  42.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.577031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>