93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12008 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  100 
 
 		 283 aa  558  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  46.18 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  37.23 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  34.77 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  37.84 
 
 		 291 aa  145  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  32.44 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1385  UbiA prenyltransferase  27.69 
 
 		 318 aa  92  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0949152  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  28.41 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  31.94 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  32.4 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0306  UbiA prenyltransferase  26.95 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  27.44 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  29.79 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  34.2 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  30.96 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  28.73 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.43 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  30.83 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.52 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  29.81 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.08 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  28.65 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  27.45 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  30.25 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  32.8 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  30 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  33.54 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  25.81 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.56 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  28.14 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  30.64 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  27.42 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  26.92 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.74 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  26.32 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.86 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  25.47 
 
 		 423 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.35 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  26.83 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  24.28 
 
 		 334 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2123  UbiA prenyltransferase  32.14 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.42 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  26 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.52 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.23 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2065  UbiA prenyltransferase  26.03 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  27.27 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  27.52 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  28.19 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3266  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.48 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0740  UbiA prenyltransferase  28.25 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.7 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.29 
 
 		 334 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  27.16 
 
 		 333 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  25.53 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  27.43 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  25.64 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  27.15 
 
 		 343 aa  52.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  24.88 
 
 		 338 aa  52.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0555  UbiA prenyltransferase  30.57 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6422  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.19 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.28 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  33.91 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3174  UbiA prenyltransferase  27.42 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.694919  normal  0.880565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  28.04 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2632  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.38 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.14 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.53 
 
 		 317 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.9 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  24.88 
 
 		 324 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.32 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.8 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1981  prenyltransferase  26.6 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.650334  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.11 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  25.45 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.03 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.24 
 
 		 339 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  28.05 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0749  UbiA prenyltransferase  27.51 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.870578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2658  UbiA prenyltransferase  22 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.53 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.79 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0159  protoheme IX farnesyltransferase (cytochrome o ubiquinol oxidase C subunit IV)  27.27 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.26 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  23.15 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.61 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4142  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  25 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356002  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  21.92 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.41 
 
 		 316 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1926  prenyltransferase  33.78 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.556074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  26.26 
 
 		 300 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000735368  normal  0.905629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>