17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2101 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2101  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 311 aa  621  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0486662  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  23.53 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.83 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  25.15 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  26.58 
 
 		 277 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.27 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.38 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.69 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  22.58 
 
 		 286 aa  49.3  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.22 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.85 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.54 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  22.69 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  24.71 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.98 
 
 		 376 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  27.93 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  22.81 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>