180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0771 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  100 
 
 
259 aa  508  1e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  41.63 
 
 
289 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  38.59 
 
 
283 aa  151  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  35.65 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  38.84 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  35.09 
 
 
267 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  36.63 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  37.04 
 
 
278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  36.65 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  36.82 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  38.17 
 
 
278 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  36.05 
 
 
277 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  31.65 
 
 
282 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  37.11 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  33.08 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  34.36 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  34 
 
 
279 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.4 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  32.2 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  33.01 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  35.93 
 
 
278 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  31.16 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  28.95 
 
 
285 aa  92.8  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  32.3 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  35.92 
 
 
291 aa  85.1  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  31.98 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.18 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.18 
 
 
295 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.67 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2061  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.33 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.1 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  32 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6422  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.06 
 
 
300 aa  72  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1852  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.12 
 
 
294 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409299 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.75 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.34 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  28.33 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.88 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.55 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.74 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.74 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.69 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.41 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  35.42 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.04 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  31.39 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.77 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.13 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.36 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  28.78 
 
 
327 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.25 
 
 
315 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.89 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.19 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.88 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.22 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  30.46 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.43 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.11 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25 
 
 
330 aa  65.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  29.71 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.04 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.5 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0306  UbiA prenyltransferase  27.95 
 
 
288 aa  62.8  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.57 
 
 
326 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  32.65 
 
 
291 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.57 
 
 
333 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.19 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.5 
 
 
330 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  28.4 
 
 
343 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.88 
 
 
337 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.67 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.74 
 
 
318 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  28.64 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.5 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.86 
 
 
339 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.15 
 
 
320 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.98 
 
 
336 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  25 
 
 
336 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  26.05 
 
 
338 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.1 
 
 
300 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.17 
 
 
316 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  29.79 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2123  UbiA prenyltransferase  31.43 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.85 
 
 
304 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  30.43 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.35 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3844  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.29 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  28.3 
 
 
335 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  35.51 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  28.17 
 
 
423 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.54 
 
 
316 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2325  UbiA prenyltransferase  63.64 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00527933  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.54 
 
 
316 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  30.77 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  26.06 
 
 
276 aa  55.8  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  28.36 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1385  UbiA prenyltransferase  24.16 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0949152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  23.72 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  24.34 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>