103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3527 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
304 aa  604  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
320 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  43.91 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  45.04 
 
 
319 aa  209  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  44.26 
 
 
301 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  38.77 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  38.77 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  38 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  36.4 
 
 
310 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  38.25 
 
 
296 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  40.43 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
291 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  38.16 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  38.77 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  38.82 
 
 
327 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.54 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  29.27 
 
 
335 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  34.15 
 
 
318 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  34.63 
 
 
295 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  36.93 
 
 
291 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.77 
 
 
286 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.65 
 
 
326 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 
294 aa  142  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  34.15 
 
 
306 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  35.47 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.29 
 
 
280 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  32.53 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 
321 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  37 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  31.5 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  34.98 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.96 
 
 
310 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.96 
 
 
310 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.96 
 
 
310 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.46 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  33.33 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  34.93 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 
302 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.74 
 
 
281 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.74 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  38.07 
 
 
483 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.42 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  34.34 
 
 
268 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  33.45 
 
 
322 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  34.29 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  30.79 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.07 
 
 
296 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
309 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  39.18 
 
 
503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  33.46 
 
 
303 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  31.25 
 
 
494 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.45 
 
 
286 aa  107  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0803  hypothetical protein  30 
 
 
479 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0855  hypothetical protein  30 
 
 
479 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719485  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  32.59 
 
 
477 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0064  hypothetical protein  32.95 
 
 
489 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  34.86 
 
 
472 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2161  hypothetical protein  30.15 
 
 
484 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  35.96 
 
 
479 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  37 
 
 
293 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7178  hypothetical protein  36.78 
 
 
475 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5788  hypothetical protein  29.33 
 
 
484 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2275  hypothetical protein  35.23 
 
 
473 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493912 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3980  hypothetical protein  34.66 
 
 
498 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0272963  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1029  hypothetical protein  28.08 
 
 
485 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  34.74 
 
 
460 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  33.52 
 
 
482 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2964  hypothetical protein  29 
 
 
479 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  37.5 
 
 
498 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0757  hypothetical protein  28.46 
 
 
481 aa  89.4  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  33.11 
 
 
508 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  29.28 
 
 
631 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  32.67 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3784  hypothetical protein  28.46 
 
 
474 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0134  UbiA prenyltransferase  29.71 
 
 
180 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00304633  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0132  putative transmembrane potein  38.95 
 
 
124 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0144788  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0898  hypothetical protein  34.44 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.897817  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  36.36 
 
 
521 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0173  hypothetical protein  29.23 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1976  UbiA prenyltransferase  25.91 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000257247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2303  hypothetical protein  26.67 
 
 
483 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223349  normal  0.0447884 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6496  UbiA prenyltransferase  27.49 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518447  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  27.57 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.82 
 
 
323 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  37.04 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.49 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  29.79 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  30.1 
 
 
472 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  28.12 
 
 
277 aa  43.9  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2102  protoheme IX farnesyltransferase  27.05 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0306599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  38.46 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>