96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3500 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 303 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  78.99 
 
 		 288 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  45 
 
 		 290 aa  229  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  44.98 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  40.77 
 
 		 318 aa  201  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  34.36 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  41.16 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  38.83 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  40.71 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  40.42 
 
 		 294 aa  175  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  40.68 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  40.68 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.62 
 
 		 285 aa  165  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  39.15 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  36.71 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.45 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  37.59 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  35.67 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  36.9 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  35.57 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  37.32 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  33.21 
 
 		 295 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  34.41 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  36.2 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  31.79 
 
 		 288 aa  139  7e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  40 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  34.32 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  38.4 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  36.92 
 
 		 309 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  38.26 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  32.18 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.78 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  34.04 
 
 		 503 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  30.65 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  36.69 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  33.46 
 
 		 477 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.47 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  34.5 
 
 		 483 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  34.38 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.48 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2161  hypothetical protein  29.82 
 
 		 484 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  32.57 
 
 		 460 aa  96.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0134  UbiA prenyltransferase  31.43 
 
 		 180 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00304633  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  32.07 
 
 		 472 aa  93.2  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7178  hypothetical protein  30.98 
 
 		 475 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  34.41 
 
 		 322 aa  92.8  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  32.11 
 
 		 479 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0803  hypothetical protein  30.48 
 
 		 479 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0855  hypothetical protein  30.48 
 
 		 479 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719485  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0757  hypothetical protein  31.06 
 
 		 481 aa  89.4  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3980  hypothetical protein  36.21 
 
 		 498 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2964  hypothetical protein  28.57 
 
 		 479 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2275  hypothetical protein  29.72 
 
 		 473 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1029  hypothetical protein  27.27 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3784  hypothetical protein  39.53 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5788  hypothetical protein  31.18 
 
 		 484 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0064  hypothetical protein  35.71 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  30.03 
 
 		 482 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  28.23 
 
 		 631 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  39.13 
 
 		 508 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0898  hypothetical protein  39.66 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.897817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  37.91 
 
 		 521 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2303  hypothetical protein  32.26 
 
 		 483 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223349  normal  0.0447884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  37.5 
 
 		 508 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  34.52 
 
 		 498 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0132  putative transmembrane potein  39.8 
 
 		 124 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0144788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0173  hypothetical protein  38.95 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1976  UbiA prenyltransferase  25.42 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000257247 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  35.25 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  35.96 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6496  UbiA prenyltransferase  25.11 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2530  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  31.37 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  35.25 
 
 		 185 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  30.43 
 
 		 423 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  34.94 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0824  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.18 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>