90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5398 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
310 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
310 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
310 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  76.14 
 
 
302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  73.2 
 
 
309 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  71.57 
 
 
309 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  70.03 
 
 
308 aa  417  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  67.96 
 
 
306 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  59.44 
 
 
308 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  55.26 
 
 
300 aa  291  9e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  45.17 
 
 
334 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  52.26 
 
 
293 aa  240  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  46.86 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.54 
 
 
331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 
326 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  43.3 
 
 
309 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  37.37 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  38.52 
 
 
295 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  38.52 
 
 
295 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  34.33 
 
 
310 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  37.72 
 
 
319 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  31.12 
 
 
295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  32.13 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.21 
 
 
301 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
296 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
291 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  37.95 
 
 
322 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  35.84 
 
 
296 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.31 
 
 
294 aa  143  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  32.78 
 
 
318 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 
321 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  31.77 
 
 
327 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  32.75 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  32.78 
 
 
327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 
320 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  31.25 
 
 
288 aa  132  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  33.67 
 
 
301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  33.58 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  33.99 
 
 
477 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3980  hypothetical protein  40.17 
 
 
498 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0272963  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
301 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  32.65 
 
 
291 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  41.36 
 
 
460 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  30.26 
 
 
288 aa  119  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  32.1 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.64 
 
 
280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  34.17 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  34.63 
 
 
482 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
296 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  39.58 
 
 
472 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  34.34 
 
 
312 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  35.87 
 
 
483 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0064  hypothetical protein  32.49 
 
 
489 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2275  hypothetical protein  37.63 
 
 
473 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  31.97 
 
 
303 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 
281 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 
281 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0757  hypothetical protein  35.45 
 
 
481 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0855  hypothetical protein  35.14 
 
 
479 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719485  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0803  hypothetical protein  35.14 
 
 
479 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7178  hypothetical protein  38.33 
 
 
475 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  34.03 
 
 
503 aa  97.4  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2964  hypothetical protein  35.14 
 
 
479 aa  95.9  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3784  hypothetical protein  39.58 
 
 
474 aa  95.9  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  33.48 
 
 
479 aa  95.9  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1029  hypothetical protein  35.94 
 
 
485 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  35.94 
 
 
494 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  34.97 
 
 
631 aa  89.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2161  hypothetical protein  36.67 
 
 
484 aa  89.7  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0898  hypothetical protein  37.5 
 
 
474 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.897817  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5788  hypothetical protein  30.61 
 
 
484 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0173  hypothetical protein  30.82 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  36.87 
 
 
508 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0132  putative transmembrane potein  40.34 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0144788  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2303  hypothetical protein  29.69 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223349  normal  0.0447884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  35.24 
 
 
508 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  33.51 
 
 
498 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0134  UbiA prenyltransferase  25.29 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00304633  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  31.73 
 
 
521 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1976  UbiA prenyltransferase  26.41 
 
 
344 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000257247 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  29.46 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6496  UbiA prenyltransferase  26.2 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>