103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0233 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
291 aa  567  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  44.68 
 
 
301 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  38.54 
 
 
310 aa  225  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
301 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  43.42 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.35 
 
 
321 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 
294 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  36 
 
 
290 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  38.38 
 
 
335 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  35.86 
 
 
318 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  33.77 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 
331 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.41 
 
 
318 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  33.12 
 
 
327 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  36.46 
 
 
315 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  37.81 
 
 
291 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  34.6 
 
 
295 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  38.04 
 
 
295 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  38.04 
 
 
295 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.58 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  38.97 
 
 
301 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  33.69 
 
 
296 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
326 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  37.88 
 
 
288 aa  181  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
280 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  33.09 
 
 
334 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  40.36 
 
 
288 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
280 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  32.74 
 
 
304 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
285 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  34.43 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
296 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  32.97 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 
284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  36.8 
 
 
268 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.3 
 
 
284 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
286 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
310 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
310 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
310 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  29.43 
 
 
308 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30 
 
 
302 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  33.21 
 
 
303 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  28.27 
 
 
300 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  29.45 
 
 
306 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  28.57 
 
 
308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  31.72 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.25 
 
 
309 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  30.28 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  30.31 
 
 
309 aa  127  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  33.52 
 
 
483 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  32.31 
 
 
477 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  30.25 
 
 
503 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0757  hypothetical protein  32.58 
 
 
481 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.24 
 
 
281 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 
281 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0855  hypothetical protein  35.08 
 
 
479 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719485  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3980  hypothetical protein  35.23 
 
 
498 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0272963  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0803  hypothetical protein  35.08 
 
 
479 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  34.27 
 
 
479 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  29.27 
 
 
494 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2964  hypothetical protein  34.9 
 
 
479 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
294 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  29.52 
 
 
482 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2275  hypothetical protein  32.11 
 
 
473 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  31.43 
 
 
472 aa  109  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2161  hypothetical protein  36 
 
 
484 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7178  hypothetical protein  33.68 
 
 
475 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  31.22 
 
 
460 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5788  hypothetical protein  33.71 
 
 
484 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1029  hypothetical protein  35.03 
 
 
485 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0134  UbiA prenyltransferase  31.07 
 
 
180 aa  96.3  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00304633  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0064  hypothetical protein  30.98 
 
 
489 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  24.3 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  22.57 
 
 
508 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  27.22 
 
 
498 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  29.05 
 
 
508 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3784  hypothetical protein  31.87 
 
 
474 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0132  putative transmembrane potein  41.74 
 
 
124 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0144788  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0898  hypothetical protein  31.11 
 
 
474 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.897817  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  24.4 
 
 
631 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2303  hypothetical protein  27.11 
 
 
483 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223349  normal  0.0447884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  28.65 
 
 
521 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0173  hypothetical protein  32.57 
 
 
474 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1976  UbiA prenyltransferase  25.83 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000257247 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6496  UbiA prenyltransferase  26.55 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518447  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  22.89 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  28.57 
 
 
283 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  34.41 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0380  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.15 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0371  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.15 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.156009  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.29 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0596  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.14 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.89 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  24.4 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  27.96 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.71 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>