15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2249 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2249  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 345 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2019  UbiA prenyltransferase  32 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.5 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  28.34 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.94 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.94 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  25.98 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  25.69 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3881  tocopherol phytyltransferase  27 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.630797  decreased coverage  0.00732369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.99 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.99 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.93 
 
 		 315 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.93 
 
 		 315 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.42 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>