299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2013 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2013  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  86.05 
 
 		 865 aa  153  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  64.77 
 
 		 866 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  62.79 
 
 		 868 aa  121  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  62.79 
 
 		 869 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  62.79 
 
 		 868 aa  120  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  62.79 
 
 		 869 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  62.79 
 
 		 868 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  61.63 
 
 		 868 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  61.63 
 
 		 868 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  61.63 
 
 		 868 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  58.62 
 
 		 868 aa  117  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  59.3 
 
 		 868 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  65.85 
 
 		 874 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  58.82 
 
 		 870 aa  114  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  64.08 
 
 		 842 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  54.55 
 
 		 871 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  66.22 
 
 		 950 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  54.55 
 
 		 891 aa  98.2  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2557  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  52.83 
 
 		 181 aa  97.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.556455  normal  0.362213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  58.14 
 
 		 907 aa  97.4  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  57.32 
 
 		 890 aa  96.3  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  55.56 
 
 		 812 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  53.85 
 
 		 873 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  64.86 
 
 		 867 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  48.84 
 
 		 758 aa  92  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  56.63 
 
 		 798 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  61.04 
 
 		 971 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  56.63 
 
 		 803 aa  91.3  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  56.63 
 
 		 803 aa  91.3  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  67.74 
 
 		 244 aa  91.3  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  50 
 
 		 869 aa  90.9  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  52.22 
 
 		 803 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  57.69 
 
 		 780 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  54.02 
 
 		 805 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  54.02 
 
 		 800 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  57.69 
 
 		 785 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  59.74 
 
 		 906 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  52.81 
 
 		 758 aa  90.5  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  59.76 
 
 		 852 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  53.33 
 
 		 769 aa  89.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  67.69 
 
 		 835 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  55.7 
 
 		 782 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  56.63 
 
 		 798 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  51.69 
 
 		 757 aa  89.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  52.87 
 
 		 781 aa  89.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  56.63 
 
 		 798 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  56.63 
 
 		 798 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  56.41 
 
 		 803 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  64.06 
 
 		 244 aa  89  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  56.41 
 
 		 804 aa  88.6  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  50.56 
 
 		 809 aa  88.6  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  50 
 
 		 796 aa  87.8  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  62.67 
 
 		 1115 aa  87.8  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  55.13 
 
 		 785 aa  87.8  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  69.23 
 
 		 246 aa  87.8  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  50 
 
 		 796 aa  87.8  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  49.41 
 
 		 302 aa  87.8  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  56.96 
 
 		 821 aa  87.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  53.85 
 
 		 891 aa  87.4  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  51.69 
 
 		 758 aa  87.4  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  55.13 
 
 		 805 aa  87.4  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  51.69 
 
 		 758 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  50 
 
 		 786 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  55.71 
 
 		 887 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  59.26 
 
 		 803 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  52.81 
 
 		 806 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  43.24 
 
 		 824 aa  86.7  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  47.96 
 
 		 796 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  68.33 
 
 		 364 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  47.78 
 
 		 809 aa  86.3  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  52.87 
 
 		 758 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  53.01 
 
 		 821 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  70.91 
 
 		 832 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  50.56 
 
 		 758 aa  85.5  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  47.78 
 
 		 810 aa  85.5  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  46.94 
 
 		 797 aa  85.5  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  69.09 
 
 		 359 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  47.25 
 
 		 760 aa  85.1  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  45.19 
 
 		 762 aa  85.1  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  45.92 
 
 		 796 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  55.13 
 
 		 754 aa  85.1  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  55.42 
 
 		 799 aa  85.1  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  68.97 
 
 		 838 aa  84.7  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  53.09 
 
 		 793 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  57.53 
 
 		 825 aa  84.3  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  48.31 
 
 		 790 aa  84.3  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  47.42 
 
 		 764 aa  84.3  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  51.11 
 
 		 798 aa  84  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  51.72 
 
 		 806 aa  84  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  58.23 
 
 		 799 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  53.16 
 
 		 779 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  55.84 
 
 		 760 aa  84  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  58.23 
 
 		 799 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  53.75 
 
 		 793 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  58.23 
 
 		 804 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  48.89 
 
 		 809 aa  83.6  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3094  phosphoenolpyruvate synthase  53.49 
 
 		 803 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421568  normal  0.0476664 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  47.67 
 
 		 799 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  52.38 
 
 		 793 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>