227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3574 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  100 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  73.66 
 
 		 244 aa  346  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  67.48 
 
 		 246 aa  301  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.13 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  48.78 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  46.91 
 
 		 244 aa  214  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  45.49 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  49.18 
 
 		 252 aa  211  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  47.13 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  47.13 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  49.39 
 
 		 252 aa  207  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  47.13 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  46.34 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  45.53 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.75 
 
 		 258 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  47.76 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  46.15 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  47.76 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  48.36 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  44.72 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  43.9 
 
 		 273 aa  198  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  43.5 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  44.26 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  44.72 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.53 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.08 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  45.93 
 
 		 250 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  43.09 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  48.78 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  48.78 
 
 		 252 aa  188  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  48.78 
 
 		 252 aa  188  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  48.54 
 
 		 243 aa  188  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  46.75 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  40.65 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  44.31 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  47.6 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  42.21 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  45.08 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  44.72 
 
 		 402 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  43.5 
 
 		 247 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.19 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  40.57 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  44.67 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  43.03 
 
 		 247 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  43.5 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  44.08 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  40.49 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  42.51 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.34 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  42.62 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  41.15 
 
 		 264 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.16 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  39.02 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 		 248 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  39.02 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  49.25 
 
 		 137 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  39.6 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.21 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  41.04 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.18 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.55 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.61 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  33.85 
 
 		 256 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  32.95 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 		 250 aa  95.5  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.14 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  33.94 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2013  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like  64.06 
 
 		 167 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.45 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  34.07 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  30.89 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.9 
 
 		 320 aa  68.6  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  30.3 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  35.82 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.83 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 295 aa  62  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  31.92 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.15 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  27.68 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  33.05 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  24.8 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.23 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.38 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 		 302 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>