More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3276 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 275 aa  538  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.86 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  41.51 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.09 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.83 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  42.29 
 
 		 247 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.52 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.82 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.8 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  35.63 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  34.9 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.02 
 
 		 253 aa  128  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  35.27 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  36.19 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  40.74 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.52 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  33.86 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  30.28 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.03 
 
 		 244 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  34.73 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  34.43 
 
 		 248 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  31.06 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  32 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  34.31 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 474 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  29.3 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  26.74 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  33.69 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  34.4 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  33.78 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  25.1 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  32.38 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  30.31 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  30.31 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  28.08 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  32.14 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  32.13 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  29.92 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3124  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05895  hypothetical protein  24.69 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  33.52 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  31.38 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  30.99 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  33.18 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  34.93 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  30.35 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  29.95 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.837895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  29.2 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  28.9 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  28.64 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  31.62 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  31.75 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  27.88 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  31.22 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  32.37 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  32.59 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  28.63 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  31 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  31 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3376  NmrA family protein  28.81 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388935  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  29.49 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  28.3 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  30.32 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  31.6 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  31.6 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  29.91 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 		 301 aa  72  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.64 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  30.77 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  33.01 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  28.24 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  31.22 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>