250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5446 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  100 
 
 		 267 aa  540  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  67.74 
 
 		 251 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  72.95 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  66.39 
 
 		 251 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  67.61 
 
 		 251 aa  328  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.27 
 
 		 251 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  63.67 
 
 		 251 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  63.27 
 
 		 251 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  63.27 
 
 		 251 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  63.93 
 
 		 250 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  62.45 
 
 		 251 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  60.89 
 
 		 250 aa  314  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  62.3 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  60.82 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  61.07 
 
 		 254 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  62.25 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  60.25 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.72 
 
 		 254 aa  289  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  56.97 
 
 		 250 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  55.69 
 
 		 247 aa  284  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  56.56 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  57.79 
 
 		 250 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  55.33 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  56.33 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  55.82 
 
 		 252 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  56.38 
 
 		 251 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  55.33 
 
 		 252 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.6 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.2 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  54.18 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  54 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  54 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  56.49 
 
 		 243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  48.98 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  47.76 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  47.76 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  55.6 
 
 		 249 aa  241  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  51.84 
 
 		 402 aa  238  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.03 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.93 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  43.85 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.61 
 
 		 246 aa  222  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  44.67 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  44.98 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  44.31 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  45.49 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  45.71 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  62.69 
 
 		 137 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.93 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  38.93 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  36.89 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  35.1 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  36.95 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.47 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  34.84 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  35.1 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  34.84 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.21 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.26 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.89 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  30.24 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.18 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  30.94 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  28.74 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  30.88 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 		 248 aa  89.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  30.8 
 
 		 269 aa  88.6  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.19 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  28.57 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  25.79 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  28.35 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  26.61 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  27.73 
 
 		 357 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  27.19 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  24.65 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.64 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  27 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.43 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.99 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.81 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.39 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 		 431 aa  59.3  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  31.18 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  26.7 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>