290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0090 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
251 aa  497  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  88.05 
 
 
251 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  88.05 
 
 
251 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  88.05 
 
 
251 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  70.12 
 
 
251 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  63.27 
 
 
267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  62.4 
 
 
251 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  66.93 
 
 
251 aa  320  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  60.16 
 
 
254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  60.8 
 
 
251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  59.92 
 
 
250 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  57.37 
 
 
254 aa  297  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  59.68 
 
 
251 aa  294  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  59.11 
 
 
251 aa  291  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  57.79 
 
 
250 aa  284  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  57.6 
 
 
273 aa  277  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  57.66 
 
 
250 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  59.68 
 
 
251 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.02 
 
 
254 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  61.04 
 
 
255 aa  271  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  57.26 
 
 
250 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  57.09 
 
 
247 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  57.38 
 
 
247 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  57.2 
 
 
251 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  54.51 
 
 
250 aa  261  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  53.82 
 
 
252 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.84 
 
 
251 aa  254  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  56.85 
 
 
402 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  56.85 
 
 
252 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  50.61 
 
 
251 aa  245  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  49.39 
 
 
250 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  49.39 
 
 
250 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  55.92 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  58.16 
 
 
243 aa  232  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  55.92 
 
 
252 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  55.92 
 
 
252 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.6 
 
 
258 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  45.97 
 
 
250 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.07 
 
 
249 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  47.58 
 
 
250 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  51.67 
 
 
244 aa  218  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  56.41 
 
 
249 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  44.72 
 
 
246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.02 
 
 
246 aa  210  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  47.54 
 
 
244 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  46.75 
 
 
244 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  44.94 
 
 
246 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  60.45 
 
 
137 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  40 
 
 
247 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  39.29 
 
 
253 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  39.52 
 
 
247 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 
248 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.45 
 
 
251 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  37.6 
 
 
249 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  38.1 
 
 
264 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  37.76 
 
 
248 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  37.65 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  36.44 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.68 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.74 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.65 
 
 
252 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.53 
 
 
252 aa  105  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  32.55 
 
 
244 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  31.84 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  31.03 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.58 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
250 aa  82  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  32.72 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  30.56 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  29.3 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  32.14 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  29.22 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  30.61 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  30.36 
 
 
341 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  27.86 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  28.31 
 
 
357 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 
303 aa  63.5  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
306 aa  62  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  31 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02430  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 
375 aa  60.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000237678  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  28.77 
 
 
343 aa  59.3  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  22.92 
 
 
320 aa  59.3  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>