244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2275 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  100 
 
 		 251 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  83.4 
 
 		 250 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  65.2 
 
 		 251 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  62.4 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  61.54 
 
 		 254 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  65.45 
 
 		 251 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  61.54 
 
 		 254 aa  314  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  60.82 
 
 		 267 aa  310  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  60.48 
 
 		 251 aa  308  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  63.31 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  60.89 
 
 		 251 aa  297  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  60.08 
 
 		 250 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.68 
 
 		 251 aa  294  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  60.41 
 
 		 251 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  60.41 
 
 		 251 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  59.36 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  60 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  62.9 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  59.36 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  59.51 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  54.58 
 
 		 250 aa  291  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  59.76 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  58.47 
 
 		 247 aa  286  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.97 
 
 		 254 aa  278  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.23 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.83 
 
 		 258 aa  272  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  58.78 
 
 		 252 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  55.82 
 
 		 252 aa  251  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  53.97 
 
 		 252 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  53.97 
 
 		 252 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  53.97 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.82 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.22 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  54.44 
 
 		 402 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  60.17 
 
 		 249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  48.16 
 
 		 251 aa  234  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  51.21 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  47.98 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.23 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  46.99 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  46.99 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  52.4 
 
 		 243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  47.58 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  45.75 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.95 
 
 		 244 aa  215  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  45.31 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  46.15 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  45.34 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  37.75 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  56.72 
 
 		 137 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  39.52 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  36.8 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  38.49 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.48 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  35.92 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  35.77 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  38.31 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  36.03 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.21 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.08 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.78 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  36.12 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  36.69 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  35.06 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  40.2 
 
 		 312 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.5 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  30.04 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  32.88 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  31.96 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  30.12 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.27 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  27.66 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.52 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.97 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  29.21 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  29.04 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.2 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  27.23 
 
 		 341 aa  62  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  24.45 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  27.72 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>