More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5088 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 264 aa  523  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  43.63 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  45.21 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.54 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  43.58 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  41 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.25 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.08 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.48 
 
 		 258 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.32 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.94 
 
 		 248 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  38.4 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  36.82 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  30.65 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  34.22 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.43 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  33.09 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  31.48 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  29.92 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  27.64 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  29.36 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  27.35 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  29.46 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  29.46 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  29.43 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  29.46 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  29.39 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  30.94 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  31.42 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  26.69 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  30.57 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2359  dehydrogenase and related protein-like protein  42.48 
 
 		 695 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0324247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  27.5 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.74 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.56 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  25.93 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  27.39 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  26.62 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  27.75 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  26.84 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  27.75 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  26.67 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  36.44 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.95 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  31.4 
 
 		 498 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  28.2 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  26.24 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1070  NmrA family protein  30.92 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.54 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.67 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.42 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.1 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  21.65 
 
 		 316 aa  53.5  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.55 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  25.27 
 
 		 317 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  31.69 
 
 		 512 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  27.21 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 		 328 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 		 295 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  28.44 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  28.77 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  24.91 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  36.52 
 
 		 340 aa  52.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 		 355 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  23.87 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  20.99 
 
 		 302 aa  52  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 		 482 aa  52  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  25.78 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  36.44 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  25.94 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  27.92 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  26.64 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  26.95 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>