More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4770 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4770  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 356 aa  738    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46098  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07060  branched-chain amino acid aminotransferase  63.1 
 
 		 357 aa  467  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0360453  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  59.48 
 
 		 350 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  47.18 
 
 		 355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  46.11 
 
 		 354 aa  335  7.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  42.02 
 
 		 358 aa  322  4e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1098  branched-chain amino acid aminotransferase  43.94 
 
 		 356 aa  311  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0823676  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1604  branched-chain amino acid aminotransferase  41.26 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.591229 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0889  branched chain amino acid aminotransferase  42.57 
 
 		 355 aa  299  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  44.01 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  42.31 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  43.91 
 
 		 356 aa  291  9e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  41.57 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  43.71 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  42.6 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  41.81 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  41.39 
 
 		 357 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  42.66 
 
 		 358 aa  282  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  42.66 
 
 		 358 aa  282  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  41.72 
 
 		 356 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  40.83 
 
 		 357 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  40.64 
 
 		 359 aa  278  8e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  39.94 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05235  branched-chain amino acid aminotransferase  40.46 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  41.28 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  42.17 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  40.95 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  40.95 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  38.29 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  41.89 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  41.94 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  41.49 
 
 		 366 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  41.49 
 
 		 366 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  40.9 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  37.22 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  40.9 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  39.41 
 
 		 370 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  38.82 
 
 		 370 aa  258  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  37.64 
 
 		 353 aa  258  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  38.7 
 
 		 358 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  37.36 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  40.06 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  39.41 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  38.76 
 
 		 365 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  39.4 
 
 		 373 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  40.83 
 
 		 359 aa  255  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  40.96 
 
 		 362 aa  255  8e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  39.36 
 
 		 371 aa  255  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  38.07 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  41.44 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  38.58 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  37.78 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  41.71 
 
 		 366 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  38.48 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  38.48 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  38.48 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  41.16 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  39.41 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  41 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  39.71 
 
 		 370 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  38.15 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  38.53 
 
 		 363 aa  242  6e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  36.84 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 		 363 aa  242  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229178  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  37.17 
 
 		 368 aa  242  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  38.82 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  34.63 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  38.39 
 
 		 375 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  36.42 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  36.42 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  39.76 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  38.84 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6122  branched-chain amino acid aminotransferase  39.64 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  35.82 
 
 		 357 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  38.99 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  37.43 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  36.23 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10560  branched chain amino acid aminotransferase  38.84 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.114756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1130  branched-chain amino acid aminotransferase  38.63 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  37.57 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3299  branched-chain amino acid aminotransferase  35.99 
 
 		 361 aa  232  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  36.94 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0289  branched-chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.351269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0340  branched-chain amino acid aminotransferase  38.05 
 
 		 363 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3634  branched-chain amino acid aminotransferase  38.05 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0310  branched-chain amino acid aminotransferase  38.05 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0278  branched-chain amino acid aminotransferase  34.81 
 
 		 363 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3830  branched-chain amino acid aminotransferase  38.05 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4146  branched-chain amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4053  branched-chain amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0327  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3649  branched-chain amino acid aminotransferase  37.71 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  35.21 
 
 		 379 aa  226  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>