More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4265 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  83.72 
 
 		 479 aa  795    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  100 
 
 		 489 aa  990    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 		 454 aa  340  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 430 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 430 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 		 431 aa  322  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 429 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 426 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 430 aa  319  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 430 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 429 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 436 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 		 453 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  38 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 441 aa  306  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 427 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 		 429 aa  290  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 424 aa  285  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 430 aa  282  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  34.98 
 
 		 480 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 441 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  33.83 
 
 		 439 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  32.97 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  33.26 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 442 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  33.62 
 
 		 439 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  34.65 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 432 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 411 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  30.95 
 
 		 424 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 425 aa  194  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 409 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  27.85 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 432 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 420 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  27.21 
 
 		 434 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  27.21 
 
 		 434 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  27.21 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  27.21 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  27.21 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  29.38 
 
 		 435 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  28 
 
 		 472 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  28 
 
 		 472 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  28 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  28.24 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  27.25 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  26.68 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  26.68 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  27.29 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  26.68 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  27.29 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  27.29 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  27.29 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  27.29 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  26.17 
 
 		 433 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  26.53 
 
 		 474 aa  149  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  26.85 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  26.32 
 
 		 425 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  26.32 
 
 		 425 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  25.59 
 
 		 433 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  25.36 
 
 		 432 aa  146  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  25.83 
 
 		 434 aa  146  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  27.93 
 
 		 432 aa  143  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 423 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 423 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 423 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  24.95 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 436 aa  140  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  26 
 
 		 433 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>