More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3990 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  100 
 
 		 494 aa  1033    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  73.56 
 
 		 502 aa  793    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  54.13 
 
 		 495 aa  565  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  54.91 
 
 		 499 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  55.56 
 
 		 499 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  52.88 
 
 		 492 aa  535  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  39.29 
 
 		 570 aa  354  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  38.25 
 
 		 570 aa  348  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  35.09 
 
 		 570 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  34.89 
 
 		 568 aa  319  9e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  34.89 
 
 		 573 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  38 
 
 		 551 aa  315  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  36.75 
 
 		 571 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  36.79 
 
 		 474 aa  299  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  36.85 
 
 		 557 aa  299  9e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  33.91 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  32.27 
 
 		 491 aa  264  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  35.81 
 
 		 421 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  34.56 
 
 		 441 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  33.54 
 
 		 495 aa  239  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  33.57 
 
 		 442 aa  229  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  31.84 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  31.48 
 
 		 501 aa  209  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  31.94 
 
 		 426 aa  206  8e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  31.1 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  31.6 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  31.37 
 
 		 422 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  31.37 
 
 		 422 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  29.89 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  26.72 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  29.67 
 
 		 485 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  27.86 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.41 
 
 		 406 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.17 
 
 		 406 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.59 
 
 		 406 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  28.91 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  28.91 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  28.91 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  28.91 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  28.91 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.88 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.59 
 
 		 414 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  29.17 
 
 		 406 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  29.17 
 
 		 406 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  29.17 
 
 		 406 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  29.17 
 
 		 406 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  29.38 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.91 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.3 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.3 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.35 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  28.31 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.59 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  26.4 
 
 		 470 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  27.69 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.04 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  29.91 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.23 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.45 
 
 		 415 aa  123  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  27.46 
 
 		 428 aa  123  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  27.11 
 
 		 682 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  29.91 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  26.71 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.18 
 
 		 621 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  27.11 
 
 		 688 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.97 
 
 		 404 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  30.03 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  26.81 
 
 		 666 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  29.73 
 
 		 405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.09 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.6 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.15 
 
 		 426 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  30 
 
 		 626 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.51 
 
 		 666 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.6 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.63 
 
 		 662 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.51 
 
 		 650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.28 
 
 		 417 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  28.04 
 
 		 421 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  27.11 
 
 		 661 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.54 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.36 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  27.95 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  24.75 
 
 		 395 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  27.49 
 
 		 410 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.01 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  25.58 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.08 
 
 		 657 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.91 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  26.85 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.22 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.07 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  25.81 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  25.81 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.45 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  27.78 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.6 
 
 		 608 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.36 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.11 
 
 		 605 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.45 
 
 		 418 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>