More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1236 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  100 
 
 		 426 aa  871    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  56.47 
 
 		 442 aa  490  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  55.19 
 
 		 441 aa  481  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  54.5 
 
 		 421 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  54.18 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  53.44 
 
 		 422 aa  441  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  53.21 
 
 		 422 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  52.97 
 
 		 422 aa  438  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  50.35 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  49.4 
 
 		 442 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  37 
 
 		 551 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  33.49 
 
 		 495 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  33.1 
 
 		 570 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  33.1 
 
 		 568 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  35.35 
 
 		 570 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  32.96 
 
 		 557 aa  237  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  32.86 
 
 		 573 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  33.64 
 
 		 571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  32.02 
 
 		 499 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  32.02 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  32.82 
 
 		 570 aa  229  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  32.17 
 
 		 492 aa  222  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  30.7 
 
 		 499 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  32.4 
 
 		 473 aa  215  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  32.49 
 
 		 502 aa  213  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  31.94 
 
 		 494 aa  206  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  29.75 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  30.82 
 
 		 495 aa  182  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  26.45 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  25.84 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.94 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.94 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  29.2 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.84 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  24.94 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  27.98 
 
 		 428 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.31 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  26.74 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1412  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.81 
 
 		 413 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1458  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.81 
 
 		 413 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  27.75 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.26 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  23.74 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.46 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  25.79 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.29 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.4 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  25.75 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  25.51 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  25.51 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  25.51 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  25.51 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  25.51 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  25.51 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  25.28 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.42 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.71 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  25.28 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  26.25 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  25.75 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.97 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  24.48 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.34 
 
 		 414 aa  100  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.08 
 
 		 412 aa  99.8  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.46 
 
 		 410 aa  99.8  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  24.82 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  24.58 
 
 		 470 aa  96.3  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  24.36 
 
 		 393 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  25.6 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  26.86 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  25.53 
 
 		 879 aa  93.6  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.02 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.23 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  25.18 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.28 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.57 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  25.19 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1322  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.43 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  24.92 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  23.87 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  24.92 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.92 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.92 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.84 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.84 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.6 
 
 		 435 aa  90.5  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  26.32 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  26.32 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.84 
 
 		 406 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  28.43 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.92 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.83 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.56 
 
 		 435 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  25.73 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.33 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  25.08 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.33 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  25.47 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  24.72 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.71 
 
 		 417 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>