More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0398 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  100 
 
 		 442 aa  905    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  58.41 
 
 		 441 aa  513  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  58.07 
 
 		 421 aa  501  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  56.47 
 
 		 426 aa  490  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  56.8 
 
 		 421 aa  485  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  55.21 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  55.48 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  55.24 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  49.07 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  50.97 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  38.92 
 
 		 551 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  37.64 
 
 		 570 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  36.32 
 
 		 499 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  36.4 
 
 		 570 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  36.15 
 
 		 570 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  36.45 
 
 		 573 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  36.45 
 
 		 568 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  35.63 
 
 		 495 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  36.08 
 
 		 557 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  34.73 
 
 		 571 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  34.09 
 
 		 499 aa  246  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  35.01 
 
 		 474 aa  240  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  33.49 
 
 		 492 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  31.84 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  31.52 
 
 		 502 aa  223  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  32.12 
 
 		 491 aa  206  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  32.61 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  32.63 
 
 		 495 aa  193  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  29.52 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  28.16 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  27.58 
 
 		 452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  27.45 
 
 		 470 aa  128  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.13 
 
 		 417 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  30.12 
 
 		 428 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  29.19 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.05 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  27.44 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.55 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  27.44 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.78 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.31 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.55 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.54 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  27.44 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  27.44 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  27.44 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.77 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.54 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  27.44 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  27.44 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  27.44 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.58 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  28.9 
 
 		 413 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  27.44 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.44 
 
 		 406 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.45 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  26.13 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.98 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  27.23 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  26.48 
 
 		 896 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  27.54 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.66 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.97 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.22 
 
 		 404 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  30.23 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  25.36 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.88 
 
 		 406 aa  104  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.54 
 
 		 419 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.64 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  26.68 
 
 		 405 aa  103  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.63 
 
 		 408 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  24.94 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.39 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.48 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  27 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  26.9 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.82 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  29.43 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.06 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.1 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.17 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  28.1 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.1 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.78 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  28.1 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.78 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.37 
 
 		 412 aa  100  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.78 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  30.45 
 
 		 381 aa  99.8  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.34 
 
 		 412 aa  99.8  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.82 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.79 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  27.02 
 
 		 626 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.78 
 
 		 406 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  27.02 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  28.04 
 
 		 879 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.78 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  29.22 
 
 		 392 aa  97.4  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1458  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.78 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>