More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0160 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  100 
 
 
442 aa  909    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  52.62 
 
 
421 aa  451  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  51.44 
 
 
442 aa  427  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  49.17 
 
 
426 aa  411  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  47.58 
 
 
421 aa  411  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  47.96 
 
 
422 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  47.96 
 
 
422 aa  398  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  49.64 
 
 
441 aa  397  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  47.48 
 
 
422 aa  395  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  44.71 
 
 
433 aa  369  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  37.44 
 
 
551 aa  310  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  35.89 
 
 
570 aa  276  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  35.84 
 
 
499 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  35.23 
 
 
570 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  33.26 
 
 
499 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  34.73 
 
 
557 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  33.48 
 
 
495 aa  243  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  33.56 
 
 
492 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  32.79 
 
 
474 aa  239  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  33.04 
 
 
571 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  32.82 
 
 
502 aa  236  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  33.03 
 
 
494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  31.75 
 
 
573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  31.75 
 
 
568 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  31.52 
 
 
570 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  32.8 
 
 
473 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  31.69 
 
 
491 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  31.3 
 
 
495 aa  196  5.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  26.97 
 
 
501 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  26.27 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  25.12 
 
 
452 aa  123  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.33 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  28.46 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  28.86 
 
 
879 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  28.71 
 
 
896 aa  116  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  27.17 
 
 
406 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.8 
 
 
406 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  28.3 
 
 
428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.43 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.15 
 
 
404 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.47 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  27.17 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  27.17 
 
 
406 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  27.17 
 
 
406 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  27.23 
 
 
405 aa  110  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  27.17 
 
 
406 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.17 
 
 
406 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  27.17 
 
 
406 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  26.9 
 
 
406 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  26.9 
 
 
406 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  26.9 
 
 
406 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  27.63 
 
 
393 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  27.65 
 
 
428 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  27.05 
 
 
408 aa  107  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  26.07 
 
 
410 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.39 
 
 
885 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.97 
 
 
435 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.63 
 
 
414 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.97 
 
 
425 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  25 
 
 
470 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.81 
 
 
441 aa  103  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.62 
 
 
878 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.89 
 
 
404 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  26.3 
 
 
441 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  27.16 
 
 
421 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.45 
 
 
428 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.17 
 
 
408 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.46 
 
 
412 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.05 
 
 
444 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.64 
 
 
413 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.49 
 
 
413 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.49 
 
 
413 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.9 
 
 
421 aa  100  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  26.09 
 
 
429 aa  99.8  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.52 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.86 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.23 
 
 
443 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  26.6 
 
 
413 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.3 
 
 
435 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  25.67 
 
 
395 aa  97.8  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  26.43 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.94 
 
 
433 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.23 
 
 
414 aa  97.1  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  26.01 
 
 
425 aa  97.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 
412 aa  96.7  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.67 
 
 
406 aa  96.7  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1458  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.43 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.86 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  25.82 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  26.97 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  26.1 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1412  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.94 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  24.63 
 
 
472 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.81 
 
 
410 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  22.82 
 
 
460 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  28.53 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.45 
 
 
409 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.68 
 
 
415 aa  94.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  28.61 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.41 
 
 
419 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>