More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2103 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  100 
 
 		 474 aa  958    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  60.54 
 
 		 491 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  56.86 
 
 		 473 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  45.74 
 
 		 570 aa  408  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  47.48 
 
 		 570 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  43.61 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  45.93 
 
 		 568 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  45.93 
 
 		 573 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  45.25 
 
 		 570 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  44.07 
 
 		 571 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  41.79 
 
 		 551 aa  317  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  38.99 
 
 		 499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  36.72 
 
 		 499 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  36.79 
 
 		 494 aa  307  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  35.96 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  35.36 
 
 		 502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  38.79 
 
 		 492 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  41.88 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  34.69 
 
 		 421 aa  259  8e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  34.11 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  34.89 
 
 		 441 aa  249  7e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  35.01 
 
 		 442 aa  249  8e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  32.02 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  33.25 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  32.71 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  32.48 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  32.48 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  30.72 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  30.44 
 
 		 501 aa  181  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  28.08 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  29.36 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.22 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  26.37 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.68 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  30.38 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.79 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  29.41 
 
 		 878 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.93 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  26.05 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  33.83 
 
 		 449 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  25.93 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  32.2 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.74 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.81 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.65 
 
 		 414 aa  114  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  29.89 
 
 		 414 aa  114  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  29.35 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  29.35 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  29.35 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  29.35 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  29.35 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  27.96 
 
 		 403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.28 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  32.54 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  29.08 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  29.08 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  29.08 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  29.08 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  30.35 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  27 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  27 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.27 
 
 		 432 aa  111  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  29.56 
 
 		 430 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  28.26 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  31.68 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.14 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.83 
 
 		 429 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.03 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  28.53 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.07 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  28.37 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  28.1 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.56 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  25.06 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.79 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.44 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.49 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  28.84 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.61 
 
 		 413 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.95 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  31.3 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.63 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.56 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.76 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.8 
 
 		 414 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.95 
 
 		 435 aa  107  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.96 
 
 		 406 aa  107  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.03 
 
 		 435 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  26.53 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  32.55 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.05 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.27 
 
 		 429 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.18 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  28.14 
 
 		 405 aa  106  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0836  cysteine desulfurase  30.95 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  27.61 
 
 		 405 aa  106  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  26.71 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.74 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  28.27 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0344832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>