More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3637 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  100 
 
 		 570 aa  1153    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  70.45 
 
 		 570 aa  773    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  51.3 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  48.99 
 
 		 571 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  48.09 
 
 		 568 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  48.29 
 
 		 570 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  47.69 
 
 		 573 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  45.74 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  42.47 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  44.21 
 
 		 491 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  47.28 
 
 		 495 aa  372  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  40.46 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  42.38 
 
 		 492 aa  362  7.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  43.64 
 
 		 551 aa  362  7.0000000000000005e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  38.59 
 
 		 495 aa  361  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  39.29 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  43.38 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  38.53 
 
 		 502 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  36.95 
 
 		 421 aa  280  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  35.89 
 
 		 442 aa  276  9e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  37.64 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  35.76 
 
 		 441 aa  267  4e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  34.79 
 
 		 421 aa  255  2.0000000000000002e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  34.49 
 
 		 422 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  34.03 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  34.26 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  32.82 
 
 		 426 aa  229  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  32.08 
 
 		 433 aa  223  7e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  32.97 
 
 		 501 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  28.81 
 
 		 442 aa  140  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  29.31 
 
 		 452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.59 
 
 		 413 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.59 
 
 		 413 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  27.41 
 
 		 413 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  27.93 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.74 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  26.36 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  29.01 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.16 
 
 		 417 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  26.26 
 
 		 416 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  23.66 
 
 		 485 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.86 
 
 		 449 aa  107  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  28.24 
 
 		 482 aa  107  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.26 
 
 		 416 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.62 
 
 		 432 aa  106  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.12 
 
 		 885 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  26.2 
 
 		 428 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  30.97 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.25 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.84 
 
 		 415 aa  105  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  27.6 
 
 		 406 aa  104  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  27.6 
 
 		 406 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  28.61 
 
 		 406 aa  104  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.2 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  27.6 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.58 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.26 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  28.61 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  28.61 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  28.61 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  27.78 
 
 		 460 aa  103  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  25.15 
 
 		 470 aa  103  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.25 
 
 		 414 aa  103  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  28.79 
 
 		 421 aa  103  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.97 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.32 
 
 		 406 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.71 
 
 		 426 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.44 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.85 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.34 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.08 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.22 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  30.13 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  29.8 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.78 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.71 
 
 		 404 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  27.32 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  27.32 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.32 
 
 		 406 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.85 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.8 
 
 		 414 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  24.75 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.79 
 
 		 418 aa  100  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.54 
 
 		 404 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.35 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  24.45 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  27.37 
 
 		 433 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.46 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25 
 
 		 417 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  27.16 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.03 
 
 		 446 aa  98.6  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.46 
 
 		 435 aa  98.2  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30 
 
 		 429 aa  98.2  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.58 
 
 		 408 aa  98.2  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  29.33 
 
 		 441 aa  97.8  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.25 
 
 		 425 aa  97.8  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.8 
 
 		 414 aa  96.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.82 
 
 		 407 aa  96.7  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.79 
 
 		 417 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.13 
 
 		 419 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>