More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2389 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  100 
 
 
472 aa  939    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  84.14 
 
 
470 aa  791    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  55.01 
 
 
478 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  54.93 
 
 
482 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  53.15 
 
 
518 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  56.87 
 
 
445 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  54.19 
 
 
439 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  54.04 
 
 
480 aa  425  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  52.58 
 
 
487 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  54.3 
 
 
429 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  54.86 
 
 
476 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  53.21 
 
 
448 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  49.1 
 
 
484 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  50.59 
 
 
452 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  47.79 
 
 
467 aa  350  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  49.07 
 
 
457 aa  349  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  48.82 
 
 
433 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  47.72 
 
 
449 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  51.26 
 
 
414 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  50.26 
 
 
414 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  41.98 
 
 
452 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  33.25 
 
 
442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  33.88 
 
 
485 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  33.09 
 
 
428 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  33.33 
 
 
428 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.67 
 
 
409 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  34.12 
 
 
470 aa  223  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.25 
 
 
415 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.75 
 
 
406 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.75 
 
 
415 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.48 
 
 
414 aa  219  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.98 
 
 
415 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.75 
 
 
406 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.92 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.92 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  35.81 
 
 
896 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.16 
 
 
416 aa  213  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.29 
 
 
426 aa  213  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  33.25 
 
 
460 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  32.42 
 
 
408 aa  212  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.74 
 
 
414 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  36.29 
 
 
879 aa  209  9e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  35.34 
 
 
395 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.41 
 
 
413 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  37.12 
 
 
404 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.69 
 
 
414 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  33.76 
 
 
413 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.78 
 
 
412 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  33.42 
 
 
414 aa  207  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.55 
 
 
414 aa  206  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.41 
 
 
413 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.96 
 
 
412 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.68 
 
 
417 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.91 
 
 
408 aa  204  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.09 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.09 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  35.34 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  33.5 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  32.34 
 
 
415 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.66 
 
 
404 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  32.75 
 
 
404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  33.16 
 
 
394 aa  199  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  33 
 
 
410 aa  199  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.7 
 
 
407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  34.32 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  34.09 
 
 
422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  32.75 
 
 
410 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  30.58 
 
 
404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  31.83 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.09 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  34.48 
 
 
417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.68 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.12 
 
 
443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.5 
 
 
414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.83 
 
 
420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.75 
 
 
414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  33.33 
 
 
403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  32.87 
 
 
417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.09 
 
 
417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  36.72 
 
 
417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  30.83 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.51 
 
 
421 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.92 
 
 
417 aa  196  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.25 
 
 
408 aa  196  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.23 
 
 
399 aa  196  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.76 
 
 
414 aa  196  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.14 
 
 
435 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.5 
 
 
417 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.99 
 
 
413 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.5 
 
 
417 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.25 
 
 
417 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.59 
 
 
405 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.23 
 
 
414 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  35.03 
 
 
393 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  33.16 
 
 
880 aa  194  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.78 
 
 
404 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.53 
 
 
412 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.08 
 
 
404 aa  193  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.6 
 
 
406 aa  194  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  34.22 
 
 
878 aa  194  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>