More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0546 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 429 aa  854    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  54.3 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  54.7 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  56.05 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  57.75 
 
 		 482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  56.33 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  59.7 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  55.42 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  55.2 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  52.26 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  49.44 
 
 		 518 aa  363  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  55.88 
 
 		 433 aa  360  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  53.01 
 
 		 448 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  51.13 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  52.29 
 
 		 457 aa  345  8e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  48.79 
 
 		 484 aa  335  7.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  52.94 
 
 		 449 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  51.77 
 
 		 452 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 414 aa  306  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  50.76 
 
 		 414 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 452 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  35.22 
 
 		 442 aa  250  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  37.06 
 
 		 485 aa  249  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.82 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  36.32 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  36.69 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.18 
 
 		 414 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  32.94 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.23 
 
 		 429 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  33.17 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  38.36 
 
 		 880 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.26 
 
 		 415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  35.61 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.6 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.93 
 
 		 407 aa  216  9e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.53 
 
 		 657 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.32 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.88 
 
 		 644 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.72 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.68 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.32 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  36.01 
 
 		 410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.95 
 
 		 404 aa  213  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.52 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.54 
 
 		 426 aa  212  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  34.18 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  36.41 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.06 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  36.25 
 
 		 896 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  33.51 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  36.01 
 
 		 879 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.9 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.06 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.9 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.82 
 
 		 451 aa  210  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  35.08 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  34.17 
 
 		 665 aa  210  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.73 
 
 		 406 aa  209  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.34 
 
 		 941 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.53 
 
 		 662 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.16 
 
 		 404 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.2 
 
 		 630 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.44 
 
 		 679 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  34.46 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  34.46 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  34.46 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  34.46 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.2 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  34.37 
 
 		 661 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  36.5 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  34.61 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  34.61 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.2 
 
 		 412 aa  206  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  34.2 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  34.2 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  35.56 
 
 		 410 aa  206  7e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  34.2 
 
 		 406 aa  206  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  34.2 
 
 		 406 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  34.2 
 
 		 406 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.44 
 
 		 605 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.17 
 
 		 560 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  33.33 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.73 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.11 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  32.56 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.79 
 
 		 678 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  35.11 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.11 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.11 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  35.11 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  34.46 
 
 		 415 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.87 
 
 		 412 aa  202  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.5 
 
 		 408 aa  203  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.15 
 
 		 406 aa  203  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.86 
 
 		 406 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  36.07 
 
 		 878 aa  202  8e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.28 
 
 		 650 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.93 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>