More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0409 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  100 
 
 		 473 aa  957    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  56.85 
 
 		 491 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  56.42 
 
 		 474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  45.3 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  43.59 
 
 		 570 aa  361  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  43.83 
 
 		 570 aa  349  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  43.5 
 
 		 570 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  43.29 
 
 		 568 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  43.09 
 
 		 573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  43.13 
 
 		 571 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 551 aa  325  8.000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  39.02 
 
 		 495 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  37.1 
 
 		 499 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  33.91 
 
 		 494 aa  270  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  32.69 
 
 		 499 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  31.7 
 
 		 495 aa  250  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  32.18 
 
 		 502 aa  249  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  34.7 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  33.57 
 
 		 421 aa  233  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  32.4 
 
 		 426 aa  220  5e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  32.78 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  33.03 
 
 		 442 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  32.61 
 
 		 442 aa  209  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  32.05 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  31.65 
 
 		 422 aa  200  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  31.41 
 
 		 422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  31.41 
 
 		 422 aa  196  9e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  28.27 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  30.88 
 
 		 501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  27.39 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  27.92 
 
 		 452 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  34.86 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  33.13 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  33.52 
 
 		 457 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  25.94 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  26.06 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  26.61 
 
 		 442 aa  117  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.17 
 
 		 416 aa  117  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  31.54 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  32.79 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.55 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  31.69 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  31.37 
 
 		 487 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  29.36 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.01 
 
 		 413 aa  110  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.85 
 
 		 429 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  31.81 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.39 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  28.61 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  30.25 
 
 		 878 aa  106  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  32.87 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.25 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1322  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.46 
 
 		 439 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.47 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  29.09 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  35.94 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.72 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  26.65 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  30.52 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.09 
 
 		 406 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3507  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.43 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.45 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.06 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.06 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.09 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  28.81 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  28.53 
 
 		 414 aa  103  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.73 
 
 		 413 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.61 
 
 		 406 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  29.67 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.34 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  35.27 
 
 		 445 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.23 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  29.15 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.01 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.82 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.76 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  26.44 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.97 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  29.04 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.16 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  28.87 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  27.4 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.74 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.73 
 
 		 429 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  27.69 
 
 		 395 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2777  aminotransferase, class V  27.7 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  33.45 
 
 		 518 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  29.79 
 
 		 401 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.36 
 
 		 885 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  25.56 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  32.11 
 
 		 480 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  27.4 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.42 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.03 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  26.82 
 
 		 393 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  34.53 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  27.71 
 
 		 399 aa  100  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  26.55 
 
 		 406 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  26.55 
 
 		 406 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>