More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1625 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  72.34 
 
 
499 aa  781    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  100 
 
 
499 aa  1038    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  54.35 
 
 
495 aa  581  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  56.9 
 
 
492 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  55.56 
 
 
494 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  53.73 
 
 
502 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  40.46 
 
 
570 aa  372  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  40.66 
 
 
570 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  41.89 
 
 
570 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  40.86 
 
 
571 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  41.67 
 
 
568 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  41.45 
 
 
573 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  40.56 
 
 
551 aa  333  4e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  38.59 
 
 
557 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  36.72 
 
 
474 aa  302  9e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  36.79 
 
 
421 aa  279  7e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  34.8 
 
 
491 aa  273  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  36.32 
 
 
442 aa  268  2e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  36.56 
 
 
442 aa  266  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  33.73 
 
 
495 aa  259  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  32.48 
 
 
473 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  33.8 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  34.52 
 
 
421 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  32.41 
 
 
501 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  32.02 
 
 
426 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  33.8 
 
 
422 aa  229  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  33.57 
 
 
422 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  33.57 
 
 
422 aa  227  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  31.71 
 
 
433 aa  204  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  29.79 
 
 
442 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  28.5 
 
 
452 aa  153  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  27.84 
 
 
470 aa  143  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  27.35 
 
 
485 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.47 
 
 
406 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.79 
 
 
414 aa  128  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.14 
 
 
406 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  27.47 
 
 
420 aa  126  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.13 
 
 
413 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.13 
 
 
413 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  27.32 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  28.44 
 
 
428 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.58 
 
 
414 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.23 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  28.44 
 
 
428 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.15 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.98 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  26.74 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  28.16 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.65 
 
 
451 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  26.28 
 
 
412 aa  118  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.15 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.87 
 
 
425 aa  117  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.16 
 
 
406 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.51 
 
 
414 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.39 
 
 
414 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.77 
 
 
394 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  27.89 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  27.89 
 
 
406 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  27.6 
 
 
395 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  27.89 
 
 
406 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.95 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.38 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.17 
 
 
419 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.94 
 
 
419 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  27.63 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.68 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.91 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  27.63 
 
 
406 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  27.63 
 
 
406 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  27.89 
 
 
406 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  27.63 
 
 
406 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  25.53 
 
 
420 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  25.93 
 
 
394 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.58 
 
 
885 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.37 
 
 
406 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  27.89 
 
 
406 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.77 
 
 
417 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  28.3 
 
 
414 aa  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  26.91 
 
 
414 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.3 
 
 
414 aa  113  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  27.57 
 
 
682 aa  113  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.59 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.28 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.42 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.86 
 
 
629 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  25.37 
 
 
423 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.42 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.65 
 
 
657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.46 
 
 
409 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.07 
 
 
662 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  30 
 
 
417 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.76 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  28.03 
 
 
414 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  28.14 
 
 
433 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.3 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  27.42 
 
 
404 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.25 
 
 
417 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  26.57 
 
 
429 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.23 
 
 
404 aa  110  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.33 
 
 
418 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>