117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2796 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2796  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 580 aa  1163    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0162  amino acid transporter  25.69 
 
 		 755 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  26.59 
 
 		 746 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  27.14 
 
 		 608 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  27.14 
 
 		 608 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  22.88 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  23.19 
 
 		 538 aa  67.8  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1104  amino acid transporter  24.02 
 
 		 676 aa  66.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  22.68 
 
 		 672 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  23.81 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0055  amino acid permease-associated region  22.1 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  23.53 
 
 		 585 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  21.94 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  22.43 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  24.68 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  26.63 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  21.46 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  23.77 
 
 		 460 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  22.97 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  22.61 
 
 		 615 aa  56.2  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 438 aa  54.7  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0974  amino acid permease-associated region  21.07 
 
 		 438 aa  53.9  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.11694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  23.78 
 
 		 474 aa  53.9  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  23.83 
 
 		 611 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  23.4 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 501 aa  52  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 488 aa  52  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  22.05 
 
 		 465 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  21.89 
 
 		 481 aa  51.6  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  23.65 
 
 		 612 aa  51.2  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 517 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  22.37 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  21.11 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  20.88 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  21.11 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  21.11 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  21.11 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  22.95 
 
 		 499 aa  49.7  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  21.11 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  21.61 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0779  amino acid permease-associated region  20.54 
 
 		 427 aa  49.3  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.047573  normal  0.0991739 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  21.11 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  21.61 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  21.11 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  22.37 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  22.88 
 
 		 491 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  23.38 
 
 		 468 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  20.56 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 439 aa  48.5  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1409  cationic amino acid transporter  24.34 
 
 		 464 aa  48.9  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  20.86 
 
 		 471 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  20.86 
 
 		 471 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4411  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528194  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  20.86 
 
 		 471 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  22.68 
 
 		 487 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 495 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 468 aa  48.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  30.06 
 
 		 686 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  21.71 
 
 		 491 aa  47.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  22.55 
 
 		 467 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  22.22 
 
 		 467 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  22.22 
 
 		 467 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 468 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 468 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 468 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 		 466 aa  47.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  18.45 
 
 		 486 aa  47  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  22.22 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  22.22 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  22.22 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  21.62 
 
 		 636 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  21.81 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  20.76 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  21.9 
 
 		 467 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 		 466 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  22.22 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 506 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  21.41 
 
 		 476 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  19.66 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  23.16 
 
 		 682 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  20.56 
 
 		 483 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  24.19 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  23.85 
 
 		 615 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1109  hypothetical protein  22.63 
 
 		 693 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  23.04 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  21.96 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  21.96 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0920  Amino acid transporter-like  22.31 
 
 		 619 aa  45.8  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  22.22 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  22.22 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  22.81 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  23.58 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  23.58 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 452 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>