155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1210 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  59.83 
 
 		 609 aa  690    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  74.39 
 
 		 608 aa  810    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  74.56 
 
 		 608 aa  812    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  74.39 
 
 		 608 aa  846    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  74.39 
 
 		 608 aa  848    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  74.22 
 
 		 608 aa  808    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  100 
 
 		 585 aa  1169    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  60.45 
 
 		 609 aa  704    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  60.45 
 
 		 609 aa  704    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  73.69 
 
 		 608 aa  813    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  74.22 
 
 		 608 aa  816    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  68.99 
 
 		 608 aa  788    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  70.56 
 
 		 608 aa  800    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  51.3 
 
 		 612 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  47.59 
 
 		 615 aa  546  1e-154  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  52.76 
 
 		 614 aa  546  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  79.37 
 
 		 365 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  47.5 
 
 		 614 aa  532  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  47.88 
 
 		 611 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  45.09 
 
 		 614 aa  477  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  44.6 
 
 		 614 aa  478  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  44.46 
 
 		 615 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  43.45 
 
 		 611 aa  455  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  43.05 
 
 		 627 aa  445  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  42.98 
 
 		 636 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  44.14 
 
 		 612 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  44.1 
 
 		 629 aa  439  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  44.39 
 
 		 629 aa  435  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  40.94 
 
 		 627 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  40.59 
 
 		 693 aa  423  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  43.59 
 
 		 672 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  43.34 
 
 		 781 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  43.59 
 
 		 668 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  40.79 
 
 		 731 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  40.33 
 
 		 653 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  40.78 
 
 		 677 aa  379  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  40.77 
 
 		 615 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  38.95 
 
 		 750 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  39.47 
 
 		 683 aa  365  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  38.12 
 
 		 672 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  39.57 
 
 		 672 aa  360  4e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  38.2 
 
 		 654 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  39.14 
 
 		 681 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  40.31 
 
 		 674 aa  355  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  37.97 
 
 		 658 aa  355  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  39.37 
 
 		 685 aa  353  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  38.71 
 
 		 704 aa  353  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  39.49 
 
 		 678 aa  353  5e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  37.81 
 
 		 664 aa  350  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  38.33 
 
 		 655 aa  350  6e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  38.35 
 
 		 619 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  39.67 
 
 		 691 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  39 
 
 		 696 aa  346  8e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  39.43 
 
 		 657 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  38.02 
 
 		 682 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  38.27 
 
 		 664 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  38.1 
 
 		 664 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  38.1 
 
 		 664 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  38.5 
 
 		 674 aa  343  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  38.74 
 
 		 667 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  37.44 
 
 		 664 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  34.49 
 
 		 647 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  39.5 
 
 		 667 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  37.6 
 
 		 678 aa  319  7e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  35.48 
 
 		 622 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  36.78 
 
 		 677 aa  307  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  75.83 
 
 		 253 aa  302  9e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  66.81 
 
 		 272 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  35.45 
 
 		 774 aa  293  5e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.74 
 
 		 815 aa  276  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.25 
 
 		 777 aa  271  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  39.1 
 
 		 470 aa  257  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  61.41 
 
 		 218 aa  225  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  31.65 
 
 		 713 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  31.65 
 
 		 713 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  33.47 
 
 		 657 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  32.16 
 
 		 657 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  33.68 
 
 		 656 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  29.92 
 
 		 685 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  28.83 
 
 		 650 aa  177  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  29.23 
 
 		 680 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  30.86 
 
 		 647 aa  160  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  30.86 
 
 		 647 aa  160  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  29.01 
 
 		 680 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  79.8 
 
 		 101 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 657 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 657 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 655 aa  77.8  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2796  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 580 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  26.17 
 
 		 746 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  30.46 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.72 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  22.81 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 443 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25.2 
 
 		 449 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  22.94 
 
 		 447 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 449 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>