108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0979 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 655 aa  1204    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  84.32 
 
 		 657 aa  839    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  84.78 
 
 		 657 aa  848    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  37.29 
 
 		 685 aa  313  9e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  37.5 
 
 		 680 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  37.61 
 
 		 680 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 		 713 aa  280  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  29.28 
 
 		 713 aa  280  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  32.83 
 
 		 657 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  31.98 
 
 		 656 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  31.92 
 
 		 657 aa  258  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  29.07 
 
 		 647 aa  238  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  29.07 
 
 		 647 aa  238  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  32.72 
 
 		 614 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  32.18 
 
 		 614 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  28.66 
 
 		 614 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  30.26 
 
 		 672 aa  141  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 		 664 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 		 664 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 		 664 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  32.29 
 
 		 677 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 627 aa  138  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  30.49 
 
 		 678 aa  137  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  33.18 
 
 		 674 aa  136  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 674 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  32.8 
 
 		 683 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 		 750 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  29.92 
 
 		 685 aa  133  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  31.69 
 
 		 672 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  28.95 
 
 		 622 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 611 aa  132  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  29.36 
 
 		 681 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  29.33 
 
 		 654 aa  130  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  27.98 
 
 		 608 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 615 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  26.65 
 
 		 609 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  25.23 
 
 		 693 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  28.34 
 
 		 704 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 		 664 aa  127  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  26.23 
 
 		 609 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  26.23 
 
 		 609 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  28.94 
 
 		 658 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.57 
 
 		 777 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  26.08 
 
 		 615 aa  125  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  29.12 
 
 		 668 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  28.05 
 
 		 615 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  29.8 
 
 		 657 aa  124  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  27.39 
 
 		 608 aa  124  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  30.32 
 
 		 696 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.31 
 
 		 781 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  30.81 
 
 		 691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  27.54 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  26.67 
 
 		 608 aa  122  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  24.7 
 
 		 627 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  29.1 
 
 		 682 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  26.72 
 
 		 608 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  27.29 
 
 		 672 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  29.53 
 
 		 647 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  33.57 
 
 		 731 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 		 653 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  31.9 
 
 		 677 aa  115  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  23.8 
 
 		 815 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 612 aa  113  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  30.06 
 
 		 678 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  29.09 
 
 		 774 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 664 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  31.49 
 
 		 611 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  27.23 
 
 		 608 aa  112  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  26.79 
 
 		 608 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  28.07 
 
 		 636 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  27.01 
 
 		 608 aa  111  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  26.79 
 
 		 608 aa  110  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  26.85 
 
 		 608 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  25.66 
 
 		 629 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  30.04 
 
 		 667 aa  109  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  26.23 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  25.13 
 
 		 629 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  27.53 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  32.6 
 
 		 619 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  26.33 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  28.53 
 
 		 365 aa  97.8  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  28.21 
 
 		 253 aa  63.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  28.25 
 
 		 650 aa  56.6  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  30.77 
 
 		 448 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  30.77 
 
 		 448 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  34.96 
 
 		 448 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  26.92 
 
 		 422 aa  50.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  24.53 
 
 		 420 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  21.2 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  24.71 
 
 		 426 aa  47.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  24.43 
 
 		 420 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  24.43 
 
 		 420 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  24.43 
 
 		 420 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  24.15 
 
 		 636 aa  47.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  24.43 
 
 		 420 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  23.95 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  25.21 
 
 		 422 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.26 
 
 		 463 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>