146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0945 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  78.02 
 
 
685 aa  990    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  94.99 
 
 
680 aa  1150    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  100 
 
 
680 aa  1345    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  48.25 
 
 
657 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  48.55 
 
 
657 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  46.25 
 
 
656 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  44.58 
 
 
647 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  44.58 
 
 
647 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  41.13 
 
 
713 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  41.13 
 
 
713 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  36.59 
 
 
657 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  36.59 
 
 
657 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  37.06 
 
 
655 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  30.19 
 
 
614 aa  208  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 
664 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 
664 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 
664 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  30.08 
 
 
614 aa  196  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  30.85 
 
 
608 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  29.67 
 
 
664 aa  195  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 
614 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  30.85 
 
 
608 aa  194  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  29.45 
 
 
627 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  29.51 
 
 
672 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  27.5 
 
 
615 aa  189  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  28.55 
 
 
664 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 
611 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  30.65 
 
 
608 aa  188  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 
615 aa  187  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.73 
 
 
781 aa  187  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  28.7 
 
 
677 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  27.2 
 
 
655 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  29.23 
 
 
585 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  29.77 
 
 
609 aa  183  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  29.15 
 
 
609 aa  183  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  29.15 
 
 
609 aa  183  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  28.62 
 
 
674 aa  182  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  27.64 
 
 
658 aa  182  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  28.35 
 
 
622 aa  181  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  26.5 
 
 
693 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  29.19 
 
 
685 aa  180  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  29.67 
 
 
668 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 
612 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  30.63 
 
 
608 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  28.51 
 
 
672 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  30.63 
 
 
608 aa  178  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 
750 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  30.63 
 
 
608 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  30.03 
 
 
672 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  28.97 
 
 
696 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  27.22 
 
 
654 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  30.57 
 
 
731 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  30.42 
 
 
608 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  30.63 
 
 
608 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  28.82 
 
 
674 aa  174  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  31.38 
 
 
615 aa  173  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  31.71 
 
 
611 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  30.87 
 
 
667 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  32.07 
 
 
614 aa  171  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  29.06 
 
 
678 aa  170  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  28.21 
 
 
683 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  28.93 
 
 
608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  29.69 
 
 
667 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  27.03 
 
 
682 aa  165  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  28.36 
 
 
647 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  24.37 
 
 
629 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  27.81 
 
 
657 aa  164  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  26.99 
 
 
678 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  29.12 
 
 
691 aa  162  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  28.66 
 
 
612 aa  161  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  24.48 
 
 
629 aa  160  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  27.17 
 
 
774 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  27.49 
 
 
627 aa  158  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  31.3 
 
 
677 aa  158  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  27.71 
 
 
681 aa  157  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 
653 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  26.89 
 
 
636 aa  147  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.23 
 
 
815 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  27.94 
 
 
704 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  32.42 
 
 
365 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.61 
 
 
777 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  28.34 
 
 
619 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  29.84 
 
 
650 aa  96.7  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  31.58 
 
 
253 aa  88.6  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  26.57 
 
 
464 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 
454 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  26.29 
 
 
464 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  38.74 
 
 
448 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  38.74 
 
 
448 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  38.74 
 
 
448 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  23.34 
 
 
746 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  22.67 
 
 
495 aa  58.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 
462 aa  57.4  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 
441 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 
521 aa  54.7  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 
455 aa  53.9  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  31.78 
 
 
453 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  31.82 
 
 
459 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  31.82 
 
 
456 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>