82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3973 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  845    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  99.78 
 
 		 448 aa  844    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  845    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  33 
 
 		 750 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  27.95 
 
 		 609 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  28.79 
 
 		 615 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  28.82 
 
 		 608 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  31.19 
 
 		 677 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  28.82 
 
 		 608 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 611 aa  87.8  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  25.71 
 
 		 609 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  25.71 
 
 		 609 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 615 aa  86.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 		 627 aa  86.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  28.96 
 
 		 672 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  27.82 
 
 		 585 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  29.85 
 
 		 612 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 		 612 aa  83.6  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.42 
 
 		 777 aa  82  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  26.9 
 
 		 615 aa  82  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  28.5 
 
 		 608 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  28.07 
 
 		 608 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  28.61 
 
 		 611 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  31.16 
 
 		 774 aa  80.1  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.01 
 
 		 781 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  26.33 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  28.26 
 
 		 608 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  28.5 
 
 		 608 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  28.78 
 
 		 608 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  28.26 
 
 		 608 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  28.26 
 
 		 608 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 614 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  28.02 
 
 		 713 aa  76.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 713 aa  76.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 653 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  25.97 
 
 		 693 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  29.3 
 
 		 685 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  28.61 
 
 		 674 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  28.21 
 
 		 668 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  32.19 
 
 		 619 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  29.29 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  26.42 
 
 		 682 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  26.09 
 
 		 627 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  28.15 
 
 		 647 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  28.15 
 
 		 647 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  26.12 
 
 		 655 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  27.23 
 
 		 656 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  29.7 
 
 		 731 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  28.2 
 
 		 657 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  26.64 
 
 		 636 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  23.88 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  26.95 
 
 		 658 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  25.97 
 
 		 629 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  26.85 
 
 		 685 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  26.89 
 
 		 647 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  28.73 
 
 		 657 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  27.88 
 
 		 680 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  25.54 
 
 		 629 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  27.32 
 
 		 680 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  27.23 
 
 		 672 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  27.46 
 
 		 683 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  28.49 
 
 		 657 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 		 470 aa  53.5  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  29.09 
 
 		 681 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  25.35 
 
 		 654 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 664 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 664 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  26.23 
 
 		 674 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  28.49 
 
 		 657 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 664 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  26.8 
 
 		 622 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  25.48 
 
 		 614 aa  50.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 664 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  26.09 
 
 		 678 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  28.54 
 
 		 667 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  27.18 
 
 		 691 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 655 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 664 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  26.76 
 
 		 704 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  26.9 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>