104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2284 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  61.9 
 
 		 668 aa  769    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  61.41 
 
 		 664 aa  783    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  55.88 
 
 		 654 aa  705    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  60 
 
 		 674 aa  712    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  56.39 
 
 		 685 aa  711    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  61.41 
 
 		 664 aa  783    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  60.34 
 
 		 664 aa  752    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  61.56 
 
 		 664 aa  783    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  59.26 
 
 		 664 aa  721    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  62.25 
 
 		 696 aa  779    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  60.58 
 
 		 657 aa  760    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  61.13 
 
 		 677 aa  702    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  57.45 
 
 		 731 aa  734    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  62.24 
 
 		 691 aa  772    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  100 
 
 		 681 aa  1358    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  55.59 
 
 		 658 aa  700    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  59.68 
 
 		 678 aa  717    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  63.34 
 
 		 674 aa  781    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  58.55 
 
 		 781 aa  714    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  57.45 
 
 		 678 aa  691    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  59.88 
 
 		 682 aa  766    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  59.43 
 
 		 672 aa  762    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  69.13 
 
 		 683 aa  901    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  59.88 
 
 		 672 aa  735    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  57.14 
 
 		 667 aa  676    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  72.77 
 
 		 704 aa  947    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  58.08 
 
 		 677 aa  691    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  57.25 
 
 		 655 aa  750    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  60.27 
 
 		 667 aa  733    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  43.84 
 
 		 614 aa  487  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  43.68 
 
 		 614 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  43.41 
 
 		 615 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  38.99 
 
 		 627 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  40.63 
 
 		 693 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  39.6 
 
 		 611 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  40.19 
 
 		 672 aa  399  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  39.22 
 
 		 608 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  39.38 
 
 		 608 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  38.91 
 
 		 608 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  37.09 
 
 		 629 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  36.98 
 
 		 611 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  35.71 
 
 		 609 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  35.71 
 
 		 609 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  39.22 
 
 		 608 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  37.62 
 
 		 608 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  38.91 
 
 		 608 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  39.64 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  39.07 
 
 		 608 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  39.29 
 
 		 612 aa  366  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  39.07 
 
 		 608 aa  365  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  38.91 
 
 		 608 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  35.46 
 
 		 609 aa  361  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  37.44 
 
 		 636 aa  360  5e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  36.01 
 
 		 629 aa  357  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  35.98 
 
 		 627 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  35.29 
 
 		 614 aa  346  8e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  38.79 
 
 		 750 aa  344  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  34.1 
 
 		 615 aa  335  1e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  35.37 
 
 		 653 aa  327  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  35.89 
 
 		 622 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  37.56 
 
 		 615 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  35.33 
 
 		 612 aa  310  5e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  34.98 
 
 		 614 aa  306  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  34.71 
 
 		 774 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  39.52 
 
 		 650 aa  294  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.98 
 
 		 815 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.33 
 
 		 647 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.1 
 
 		 777 aa  267  5e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  43.01 
 
 		 365 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.95 
 
 		 619 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  37.94 
 
 		 470 aa  199  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 		 713 aa  192  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  32.37 
 
 		 713 aa  192  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  29.59 
 
 		 657 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  29.91 
 
 		 657 aa  158  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  27.48 
 
 		 656 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  29.26 
 
 		 685 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  27.73 
 
 		 680 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  26.56 
 
 		 680 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  43.81 
 
 		 253 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  35.13 
 
 		 272 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  25.35 
 
 		 647 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  25.35 
 
 		 647 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  34.97 
 
 		 657 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  34.68 
 
 		 657 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  31.16 
 
 		 218 aa  87.4  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 655 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  48.86 
 
 		 101 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  25.53 
 
 		 746 aa  60.8  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  33.96 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  33.49 
 
 		 448 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  33.49 
 
 		 448 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0162  amino acid transporter  25.13 
 
 		 755 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1104  amino acid transporter  25.4 
 
 		 676 aa  52.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 440 aa  48.1  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 447 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 521 aa  45.8  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  23.19 
 
 		 636 aa  44.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1862  amino acid transporter  24.07 
 
 		 649 aa  44.3  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  23.01 
 
 		 452 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>