120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7673 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  50.45 
 
 		 774 aa  685    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 815 aa  1648    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  42.86 
 
 		 777 aa  546  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.79 
 
 		 781 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  36.98 
 
 		 615 aa  334  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  37.34 
 
 		 611 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  35.79 
 
 		 614 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  35.2 
 
 		 627 aa  327  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  34.49 
 
 		 614 aa  320  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  32.46 
 
 		 629 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  32.84 
 
 		 693 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  32.7 
 
 		 609 aa  308  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  33.78 
 
 		 682 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  33.19 
 
 		 664 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  33.19 
 
 		 664 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 664 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  33.23 
 
 		 677 aa  302  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  32.12 
 
 		 609 aa  301  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  32.12 
 
 		 609 aa  301  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  33.19 
 
 		 664 aa  300  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  31.85 
 
 		 629 aa  297  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  34 
 
 		 672 aa  296  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  33.07 
 
 		 608 aa  294  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  32.91 
 
 		 608 aa  294  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  32.95 
 
 		 672 aa  291  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  33.04 
 
 		 664 aa  289  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  32.95 
 
 		 683 aa  289  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  32.63 
 
 		 668 aa  288  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  33.68 
 
 		 655 aa  288  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  33.09 
 
 		 657 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 612 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  33.58 
 
 		 674 aa  283  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  31.72 
 
 		 731 aa  282  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  31.65 
 
 		 627 aa  281  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  32.81 
 
 		 611 aa  280  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  32.34 
 
 		 704 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  36.43 
 
 		 615 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  32.23 
 
 		 608 aa  279  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  32.2 
 
 		 615 aa  274  4.0000000000000004e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  34.74 
 
 		 585 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  31.26 
 
 		 614 aa  273  6e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  33.7 
 
 		 608 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  32.37 
 
 		 696 aa  271  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  31.67 
 
 		 681 aa  270  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  32.54 
 
 		 667 aa  270  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  33.07 
 
 		 608 aa  269  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  33.07 
 
 		 608 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  33.39 
 
 		 608 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  33.7 
 
 		 608 aa  267  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  33.39 
 
 		 608 aa  266  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  33.28 
 
 		 750 aa  264  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  32.23 
 
 		 685 aa  263  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  31.99 
 
 		 678 aa  261  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  32.28 
 
 		 672 aa  260  7e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  31.8 
 
 		 658 aa  259  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  32.19 
 
 		 654 aa  258  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  32.51 
 
 		 674 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  32.52 
 
 		 691 aa  255  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  33.38 
 
 		 678 aa  253  8.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  33.48 
 
 		 677 aa  246  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  32.09 
 
 		 614 aa  244  5e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  30.87 
 
 		 612 aa  243  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  31.55 
 
 		 667 aa  239  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  30.06 
 
 		 636 aa  228  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 653 aa  228  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  32.17 
 
 		 619 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  32.62 
 
 		 647 aa  219  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  37.13 
 
 		 365 aa  209  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  36.62 
 
 		 470 aa  193  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  28.94 
 
 		 622 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  30.34 
 
 		 657 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  28.18 
 
 		 656 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 713 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  29.32 
 
 		 713 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 657 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  28.19 
 
 		 685 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  26.83 
 
 		 647 aa  145  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  26.83 
 
 		 647 aa  145  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  26.71 
 
 		 680 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  26.48 
 
 		 680 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  36.2 
 
 		 253 aa  115  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  27.3 
 
 		 650 aa  108  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 657 aa  87.8  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 657 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1920  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  46.51 
 
 		 122 aa  84  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1408  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  49.41 
 
 		 126 aa  82  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16140  OB-fold nucleic acid binding protein  50 
 
 		 122 aa  80.1  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.24417  normal  0.140824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1705  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  47.78 
 
 		 122 aa  80.1  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041605  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2288  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  50 
 
 		 136 aa  80.1  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.208905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1708  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  50 
 
 		 140 aa  80.1  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6762  hypothetical protein  47.67 
 
 		 130 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2906  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  43.59 
 
 		 120 aa  77.8  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  28.94 
 
 		 272 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5194  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  45.05 
 
 		 133 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1559  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  47.5 
 
 		 133 aa  75.5  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1874  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  49.3 
 
 		 125 aa  75.5  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.809864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1939  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  47.83 
 
 		 125 aa  75.5  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0266133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1320  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  45.24 
 
 		 128 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1518  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  45.33 
 
 		 125 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 655 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>