34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1874 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1874  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 125 aa  254  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.809864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1483  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  56.1 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.311126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1448  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  54.47 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362896  hitchhiker  0.00185234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1518  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  54.78 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4530  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  50 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.471284  normal  0.96843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5194  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  46.96 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3759  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  47.41 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000195946  normal  0.398005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1400  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  47.9 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1708  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  49.52 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248195  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3930  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  45.69 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0928391  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2470  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  44.92 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.216244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1705  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  48.28 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041605  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2183  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  43.22 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28168  hitchhiker  0.00382981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2240  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  43.22 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2254  hypothetical protein  45.69 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0978223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  43.22 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1320  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  46.72 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1920  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  50.47 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16140  OB-fold nucleic acid binding protein  48.15 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.24417  normal  0.140824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2906  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  45.19 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6762  hypothetical protein  42.5 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  43.75 
 
 		 781 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12709  hypothetical protein  44.92 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1559  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  47.75 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2288  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  46.08 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.208905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1939  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  46.9 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0266133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1408  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  54.79 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  49.3 
 
 		 815 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  42.7 
 
 		 774 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.63 
 
 		 777 aa  60.1  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1631  hypothetical protein  35.63 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113921 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13100  hypothetical protein  46.51 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00241513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1638  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0363241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 747 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>