31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1638 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1638  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  260  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0363241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1631  hypothetical protein  59.29 
 
 
117 aa  124  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1705  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.82 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041605  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1708  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  54.55 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1400  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  36.11 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13100  hypothetical protein  36.89 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00241513  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1920  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  51.92 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6762  hypothetical protein  47.73 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16140  OB-fold nucleic acid binding protein  51.16 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.24417  normal  0.140824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2288  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  38.64 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.208905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2906  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  32.73 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1518  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  47.5 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3759  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  39.53 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000195946  normal  0.398005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1874  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  50 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.809864  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1408  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40.82 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1559  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.53 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  45.45 
 
 
774 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12709  hypothetical protein  46.67 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11862  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5194  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  46.34 
 
 
133 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1320  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  46.34 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2254  hypothetical protein  40.91 
 
 
124 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0978223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  38.78 
 
 
815 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3930  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  40 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0928391  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2183  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  40 
 
 
123 aa  43.5  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28168  hitchhiker  0.00382981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2240  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  40 
 
 
123 aa  43.5  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519267  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2470  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  40 
 
 
131 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.216244  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1939  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.03 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0266133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  40 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1448  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40.91 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362896  hitchhiker  0.00185234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1483  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  38.64 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.311126  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  42.5 
 
 
781 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>