26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_13100 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_13100  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  205  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00241513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1638  hypothetical protein  36.89 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0363241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1631  hypothetical protein  37.78 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3759  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  48.89 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000195946  normal  0.398005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2906  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  45.45 
 
 
120 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1874  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  46.51 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.809864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1518  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.37 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16140  OB-fold nucleic acid binding protein  45.83 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.24417  normal  0.140824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2254  hypothetical protein  47.5 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0978223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2470  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  34.18 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.216244  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1400  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  36.59 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3930  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  32.91 
 
 
136 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0928391  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1705  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  38.55 
 
 
122 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041605  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1920  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  46.51 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12709  hypothetical protein  32.91 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11862  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1708  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40.91 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  44.74 
 
 
781 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1408  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.07 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2183  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  31.65 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28168  hitchhiker  0.00382981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2240  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  31.65 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6762  hypothetical protein  30.95 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  31.65 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1448  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40 
 
 
126 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362896  hitchhiker  0.00185234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1483  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  40 
 
 
126 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.311126  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  34.78 
 
 
774 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1320  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  38 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.434998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>