158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1943 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  64.02 
 
 		 658 aa  821    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  58.48 
 
 		 655 aa  715    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  61.66 
 
 		 668 aa  733    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  63.02 
 
 		 683 aa  771    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  68.7 
 
 		 667 aa  840    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  63.25 
 
 		 664 aa  776    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  65.74 
 
 		 654 aa  827    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  72.16 
 
 		 667 aa  912    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  64.59 
 
 		 674 aa  762    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  63.29 
 
 		 685 aa  788    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  63.25 
 
 		 664 aa  776    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  62.13 
 
 		 664 aa  758    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  63.4 
 
 		 664 aa  776    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  60.36 
 
 		 664 aa  734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  62.71 
 
 		 696 aa  736    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  62.52 
 
 		 657 aa  754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  100 
 
 		 678 aa  1340    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  69.18 
 
 		 677 aa  797    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  73.44 
 
 		 672 aa  947    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  58.27 
 
 		 731 aa  710    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  64.12 
 
 		 691 aa  734    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  64.17 
 
 		 674 aa  759    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  63.48 
 
 		 704 aa  752    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  57.89 
 
 		 677 aa  709    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  59.72 
 
 		 781 aa  739    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  67.85 
 
 		 678 aa  832    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  59.68 
 
 		 681 aa  724    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  62.31 
 
 		 682 aa  777    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  62.9 
 
 		 672 aa  769    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  43.61 
 
 		 614 aa  481  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  43.01 
 
 		 614 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  42.61 
 
 		 615 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  41.54 
 
 		 627 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  41.3 
 
 		 672 aa  432  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  39.56 
 
 		 693 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  40.69 
 
 		 611 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  36.21 
 
 		 609 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  36.21 
 
 		 609 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  37.54 
 
 		 608 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  38.23 
 
 		 611 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  36.67 
 
 		 608 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  37.38 
 
 		 608 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  36.79 
 
 		 636 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  36.59 
 
 		 609 aa  372  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  35.02 
 
 		 627 aa  372  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  36.07 
 
 		 629 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  36.1 
 
 		 629 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  35.09 
 
 		 608 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  37.13 
 
 		 612 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  37.6 
 
 		 585 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  35.02 
 
 		 614 aa  351  3e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  36.77 
 
 		 608 aa  350  7e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  36.52 
 
 		 608 aa  348  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  36.62 
 
 		 608 aa  346  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  37.08 
 
 		 608 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  36.36 
 
 		 608 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  34.8 
 
 		 615 aa  338  1.9999999999999998e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  37.68 
 
 		 750 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  42.24 
 
 		 650 aa  329  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  37.07 
 
 		 653 aa  324  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  36.48 
 
 		 615 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  35.11 
 
 		 612 aa  311  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  35.54 
 
 		 614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  34.62 
 
 		 622 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  35.76 
 
 		 647 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  33.23 
 
 		 774 aa  292  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.53 
 
 		 815 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.47 
 
 		 777 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  35.04 
 
 		 619 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  40.63 
 
 		 365 aa  244  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  37.91 
 
 		 470 aa  211  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  28.57 
 
 		 657 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  30.04 
 
 		 713 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  30.04 
 
 		 713 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  27.71 
 
 		 685 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  27.54 
 
 		 656 aa  177  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 657 aa  174  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  27.94 
 
 		 680 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  28.25 
 
 		 680 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  27.32 
 
 		 647 aa  144  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  27.32 
 
 		 647 aa  144  7e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  32.5 
 
 		 272 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  41.03 
 
 		 253 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  32.41 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  31.66 
 
 		 657 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  27.36 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 655 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  44.09 
 
 		 101 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 455 aa  60.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 444 aa  57  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 455 aa  57  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  31.39 
 
 		 443 aa  54.3  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1104  amino acid transporter  24.94 
 
 		 676 aa  53.9  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 447 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 		 443 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  24.36 
 
 		 463 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 456 aa  52  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  24.36 
 
 		 463 aa  52  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.81 
 
 		 449 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25.81 
 
 		 449 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>