174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1635 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  57.45 
 
 
704 aa  697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  62.4 
 
 
667 aa  792    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  55.59 
 
 
681 aa  672    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  55.5 
 
 
655 aa  699    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  54.57 
 
 
668 aa  683    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  62.2 
 
 
667 aa  779    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  58.9 
 
 
664 aa  744    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  58.27 
 
 
683 aa  738    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  92.8 
 
 
654 aa  1204    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  59.85 
 
 
674 aa  728    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  58.45 
 
 
674 aa  702    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  58.36 
 
 
685 aa  747    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  58.9 
 
 
664 aa  744    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  58.02 
 
 
664 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  58.9 
 
 
664 aa  744    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  63.76 
 
 
672 aa  809    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  58.23 
 
 
664 aa  700    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  60.55 
 
 
696 aa  741    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  64.02 
 
 
678 aa  770    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  56.4 
 
 
657 aa  698    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  62.56 
 
 
677 aa  736    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  54.76 
 
 
677 aa  668    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  51.3 
 
 
731 aa  672    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  61.37 
 
 
691 aa  724    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  57.54 
 
 
682 aa  724    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  55.35 
 
 
781 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  100 
 
 
658 aa  1316    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  58.55 
 
 
672 aa  728    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  60.49 
 
 
678 aa  758    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  44.34 
 
 
614 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  42.9 
 
 
614 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  41.78 
 
 
615 aa  442  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  40.09 
 
 
693 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  40.68 
 
 
611 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 
627 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  39.16 
 
 
672 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  37.36 
 
 
609 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  37.88 
 
 
611 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  36.32 
 
 
609 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  36.32 
 
 
609 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  37.56 
 
 
608 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  37.4 
 
 
608 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  42.49 
 
 
650 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  36.48 
 
 
608 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  37.06 
 
 
629 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  37.5 
 
 
608 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  37.5 
 
 
608 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  37.83 
 
 
608 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  35.83 
 
 
629 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  36.27 
 
 
627 aa  372  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  37.5 
 
 
608 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  37.44 
 
 
608 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  35.81 
 
 
608 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  37.2 
 
 
636 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  38.85 
 
 
612 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  37.97 
 
 
585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  35.24 
 
 
614 aa  348  2e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  34.4 
 
 
615 aa  347  4e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  35.76 
 
 
750 aa  337  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  36.67 
 
 
614 aa  324  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  35.16 
 
 
653 aa  319  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 
612 aa  318  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  35.26 
 
 
622 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  32.88 
 
 
774 aa  301  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  33.39 
 
 
615 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.03 
 
 
647 aa  297  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.21 
 
 
777 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  42.71 
 
 
365 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.8 
 
 
815 aa  266  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  32.51 
 
 
619 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  37.34 
 
 
470 aa  208  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  28.15 
 
 
685 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  31.82 
 
 
713 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  31.82 
 
 
713 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  27.44 
 
 
657 aa  183  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  26.58 
 
 
656 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 
657 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  26.44 
 
 
680 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  25.94 
 
 
680 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  40.51 
 
 
253 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  25.55 
 
 
647 aa  133  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  25.55 
 
 
647 aa  133  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  31.91 
 
 
272 aa  119  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 
657 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 
657 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  29.88 
 
 
655 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  44.68 
 
 
101 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  27.05 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  26.37 
 
 
746 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  25.88 
 
 
462 aa  63.9  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0848  hypothetical protein  23.71 
 
 
658 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.19 
 
 
441 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  24.29 
 
 
461 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  24.29 
 
 
461 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4502  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 
461 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4510  putative amino acid transporter  27.37 
 
 
647 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1828  hypothetical protein  24.81 
 
 
650 aa  52.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  24.07 
 
 
461 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  24.07 
 
 
461 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  24.07 
 
 
461 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>