136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1503 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  100 
 
 		 614 aa  1246    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  52.19 
 
 		 612 aa  615  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  52.99 
 
 		 614 aa  598  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  49.03 
 
 		 615 aa  592  1e-168  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  46.34 
 
 		 608 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  47.48 
 
 		 608 aa  559  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  46.18 
 
 		 608 aa  557  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  46.5 
 
 		 608 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  46.83 
 
 		 608 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  47.5 
 
 		 585 aa  531  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  46.5 
 
 		 608 aa  528  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  43.74 
 
 		 609 aa  529  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  43.74 
 
 		 609 aa  529  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  46.5 
 
 		 608 aa  531  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  46.67 
 
 		 608 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  45.2 
 
 		 608 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  42.35 
 
 		 609 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  40.93 
 
 		 614 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  40.68 
 
 		 614 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  39.68 
 
 		 611 aa  415  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  37.98 
 
 		 693 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  38.92 
 
 		 627 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  39.02 
 
 		 611 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  38.33 
 
 		 629 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  37.44 
 
 		 615 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  37.46 
 
 		 629 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  36.01 
 
 		 672 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.11 
 
 		 781 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  36.76 
 
 		 612 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  52.54 
 
 		 365 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  34.56 
 
 		 627 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 		 664 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  36.11 
 
 		 674 aa  348  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  34.6 
 
 		 685 aa  347  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  34.92 
 
 		 654 aa  344  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  35.66 
 
 		 672 aa  343  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  33.64 
 
 		 750 aa  341  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  35.69 
 
 		 668 aa  340  4e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  34.21 
 
 		 677 aa  339  7e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  35.66 
 
 		 682 aa  340  7e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  35.24 
 
 		 658 aa  339  7e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  34.63 
 
 		 655 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  34.47 
 
 		 674 aa  339  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  34.35 
 
 		 681 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  33.98 
 
 		 636 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  35.38 
 
 		 672 aa  335  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  35.24 
 
 		 664 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  35.24 
 
 		 664 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  34.7 
 
 		 664 aa  334  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  35.16 
 
 		 731 aa  333  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  34.83 
 
 		 657 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  34.74 
 
 		 696 aa  326  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  34.51 
 
 		 678 aa  325  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  35.5 
 
 		 664 aa  323  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  35.2 
 
 		 691 aa  323  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  34.41 
 
 		 678 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.79 
 
 		 683 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  32.76 
 
 		 653 aa  314  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  32.97 
 
 		 704 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  34.63 
 
 		 667 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.61 
 
 		 619 aa  306  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  33.12 
 
 		 615 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  34.57 
 
 		 667 aa  300  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  34.73 
 
 		 677 aa  299  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  34.98 
 
 		 622 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.18 
 
 		 777 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  30.1 
 
 		 774 aa  282  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  32.18 
 
 		 647 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.26 
 
 		 815 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  38.93 
 
 		 470 aa  235  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  53.17 
 
 		 253 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  26.89 
 
 		 685 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  32.81 
 
 		 713 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  32.81 
 
 		 713 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  32.39 
 
 		 647 aa  192  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  32.39 
 
 		 647 aa  192  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  38.52 
 
 		 272 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  30.32 
 
 		 657 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  29.69 
 
 		 657 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  30.47 
 
 		 680 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  26.62 
 
 		 656 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  29.04 
 
 		 680 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  25.97 
 
 		 650 aa  159  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  34.09 
 
 		 218 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 657 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 657 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  29.37 
 
 		 655 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  53.76 
 
 		 101 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2796  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 580 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 455 aa  56.2  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  24.27 
 
 		 449 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.53 
 
 		 449 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  23.9 
 
 		 460 aa  54.7  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  26.88 
 
 		 448 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  26.88 
 
 		 448 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  26.88 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  31.78 
 
 		 443 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  30.84 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>